أكثر

استيراد رموز SVG إلى QGIS


لقد قمت بتنزيل حزمة رمز SVG من https://www.mapbox.com/maki/

استخدام الاستيراد من URL لم ينجح معي أبدًا ، فكيف يمكنني استيراد هذه الرموز إلى QGIS؟

بقدر ما أستطيع أن أقول أنني بحاجة إلى .XML يحدد كل رمز.


هناك طريقة أخرى تتمثل في توجيه SVG مضيفًا مساره في:

إعدادات-> خيارات-> النظام-> مسار SVG

بهذه الطريقة ستجد رموز SVG الخاصة بك كمجموعة في QGIS styler (خصائص الطبقة-> النمط ...)


أتمنى أن يكون هذا ما تبحث عنه:

  1. تأكد من أن لديك المسار الصحيح إلى دليل svg الخاص بك.
  2. انتقل إلى خصائص الطبقة> النمط ، انقر فوق علامة بسيطة (أدناه علامة) ، ثم في علامة تبويب طبقة الرموز ، قم بتغييرها إلى علامة svg (في الموافقة المسبقة عن علم)


الطريقة الأكثر ملاءمة الآن لمشاركة SVG في QGIS هي استخدام البرنامج المساعد QGIS Resource Sharing (يمكنك تثبيته من QGIS Plugin Manager). يتم شحن أيقونات Maki إلى أحد المستودعات المعتمدة التي يمكنك استخدامها على الفور. اقرأ المزيد حول هذا المكون الإضافي هنا http://www.akbargumbira.com/qgis_resources_sharing/


[التحقق QGIS 2.14 / 2.18]

هناك طريقة أخرى وهي إنشاء مجلد جديد تحتC: / المستخدمون / اسمك /. qgis2وسمهاsvg. هذا الجديدC: / المستخدمون/your_name/.qgis2/svgيتم التعرف عليه تلقائيًا بواسطة QGIS باعتباره المسار المحدد مسبقًارموز المستخدممجموعة.

ثم انسخ الرموز التي تم تنزيلها فيه. مجلد المستوى الأعلى (أدناهsvg) سيصبح اسم المجموعة الفرعية.

وبالتالي،C: / المستخدمون/your_name/.qgis2/svg/MAKIسوف يكون:


(تحديث لـ QGIS 3.0)

QGIS 3.0 لا يستخدم.qgis2مجلد بعد الآن ، لذلك يجب التحقق من الموقع عن طريق الفتحالإعدادات | ملفات تعريف المستخدم | افتح مجلد ملف التعريف النشط.

يخلقsvgمجلد في هذا الموقع. ثم مرة أخرى ، سوف تتعرف عليه QGIS على أنها مستخدمsvgمجلد.


ما عليك سوى نسخ المجلد الذي يحتوي على رموز SVG إلى مجلد QGIS SVG. على نظام التشغيل Windows ، يكون C: OSGeo4W64_2.8.1 apps qgis svg اعتمادًا على مسار التثبيت الخاص بك. أعد تشغيل QGIS إذا كان مفتوحًا عند النسخ.


شكراً كازوهيتو ، لقد نجح ذلك معي. في نظام MacOS ، مسار QGIS 3 هو / Users /اسم االمستخدم/ دعم المكتبة / التطبيق / QGIS / QGIS3 / ملفات التعريف / افتراضي / svg

من هناك يمكنك تعديل ملفات SVG دون فتح البرنامج ، على الرغم من أن QGIS يبدو أنه يقوم بتحديث هذه الملفات دون إعادة التشغيل.


ملف Crafter للحيوانات الزهرية

قم بتنزيل ملف Crafter للحيوانات الزهرية مجانًا - قم بإنشاء مشاريع DIY الخاصة بك باستخدام Cricut Explore و Silhouette والمزيد. تتضمن الملفات المقطوعة المجانية ملفات SVG و DXF و EPS و PNG.

مكتبة ضخمة من ملفات SVG المجانية لتنزيلها على الفور وإنشاء مشاريع DIY الخاصة بك اليوم! تتوافق الملفات مع Cricut Explore Air 2 و Cricut Maker و Silhouette وجميع آلات القطع تقريبًا! لدينا يونيكورن وحورية البحر واقتباس ملهم والمزيد من تصميمات SVG المجانية التي لا يمكنك تفويتها!

قم بتنزيل ملف Floral Animals Crafter المجاني المتوفر بجميع التنسيقات: SVG / PNG / DXF / EPS ، متوافق مع Cricut و Silhouette والمزيد ، تأتي جميع التصميمات مع رخصة تجارية تجارية صغيرة. تعد ملفات SVG المقطوعة هذه رائعة للاستخدام مع Silhouette Cameo Cricut والمزيد.


الملخص

في أوروبا، ديروفيلاريا إميتيس يستمر بشكل رئيسي في بلدان الجنوب مع مناخ البحر الأبيض المتوسط. ولأن انتشار الديدان القلبية من هذه البلدان نحو البلدان الشمالية يمكن ملاحظته في العقود الماضية ، فقد تمت مراجعة سجلات تشريح 4076 كلبًا مجريًا بحثًا عن إصابات بالديدان القلبية. أول كلب أصلي د تم اكتشاف الحالة في سهل المجر العظيم في عام 2007. حتى عام 2011 ، كان عدد حالات الإصابة بالديدان القلبية منخفضًا ، وكانت هذه الحالات مقتصرة على جزء صغير من السهل المجري العظيم. منذ عام 2012 ، زاد عدد الحالات بشكل كبير ، ويمكن أيضًا ملاحظة التوسع السريع في النطاق الجغرافي للطفيلي. كشفت دراستنا بأثر رجعي أن معظم الأراضي المجرية أصبحت منطقة مستوطنة بالديدان القلبية ، وتضاعف انتشار العدوى بشكل كبير خلال الـ 12 عامًا الماضية. إنشاء وسرعة انتشار وظهور د يمكن تفسيره بشكل رئيسي من خلال ارتفاع درجة حرارة المناخ في المجر. ومع ذلك ، فإن الانتشار المدفوع جزئيًا بالمناخ لأهم خزان مضيف في الحياة البرية ، ابن آوى الذهبي (Canis aureus) من شبه جزيرة البلقان المتوسطية لعبت أيضًا دورًا مهمًا. هذه الدراسة هي مثال على الانتشار السريع وظهور مسببات الأمراض الناتجة عن التغيرات المناخية والبيئية التي يحركها المناخ. نظرًا لأنه من المتوقع حدوث زيادة مستمرة في درجة الحرارة والمزيد من تشتت ابن آوى الذهبي في أوروبا ، فمن المتوقع انتشار المزيد من الدودة القلبية وظهورها. انتشار مماثل وظهور D. immitis يمكن ملاحظتها في أمريكا الشمالية. لا يمكن استبعاد وجود أسباب مماثلة (الاحتباس الحراري والتشتت السريع والنمو السكاني لأهم مضيف مكامن للكلاب البرية) في الخلفية في كلتا القارتين.


محتويات

تُستخدم Qt لتطوير واجهات المستخدم الرسومية (GUI) والتطبيقات متعددة المنصات التي تعمل على جميع منصات سطح المكتب الرئيسية ومعظم المنصات المحمولة أو المدمجة. تحتوي معظم برامج واجهة المستخدم الرسومية التي تم إنشاؤها باستخدام Qt على واجهة أصلية المظهر ، وفي هذه الحالة يتم تصنيف Qt على أنه ملف مجموعة أدوات القطعة. يمكن أيضًا تطوير البرامج غير ذات واجهة المستخدم الرسومية ، مثل أدوات سطر الأوامر ووحدات التحكم الخاصة بالخوادم. مثال على برنامج غير واجهة المستخدم الرسومية باستخدام Qt هو إطار عمل الويب Cutelyst. [14]

تدعم Qt العديد من المجمعات ، بما في ذلك مترجم GCC C ++ ومجموعة Visual Studio و PHP عبر امتداد PHP5 ، [15] ولديها دعم تدويل واسع النطاق. يوفر Qt أيضًا Qt Quick ، ​​والذي يتضمن لغة برمجة نصية تعريفية تسمى QML تسمح باستخدام JavaScript لتوفير المنطق. مع Qt Quick ، ​​أصبح التطوير السريع للتطبيقات للأجهزة المحمولة ممكنًا ، بينما لا يزال من الممكن كتابة المنطق باستخدام كود أصلي أيضًا لتحقيق أفضل أداء ممكن.

تشمل الميزات الأخرى الوصول إلى قاعدة بيانات SQL ، وتحليل XML ، وتحليل JSON ، وإدارة الخيط ودعم الشبكة.

أحدث إصدار هو Qt 6.0 ، والذي تم إصداره في 8 ديسمبر 2020. [16]

إصدار الدعم طويل الأجل الحالي (LTS) هو Qt 5.15 LTS. تقوم شركة Qt بنقل Qt 5.15 إلى مرحلة LTS التجارية فقط بدءًا من 5 يناير 2021.

كما أن Qt 5.12 هو إصدار LTS [17] الإصدار الفعلي هو 5.12.10.

كان الإصدار الأولي لبرنامج Qt في 20 مايو 1995.

في عام 2017 ، قدرت شركة Qt مجتمعًا بحوالي مليون مطور حول العالم [18] في أكثر من 70 صناعة. [19]

تحرير واجهة مستخدم سطح المكتب

واجهات المستخدم الرسومية وبيئات سطح المكتب التي تستخدم Qt / QML كأداة أدوات:

    ، بيئة سطح المكتب الليبرالية لمختلف أجهزة الحوسبة [20]
  • DDE (بيئة سطح المكتب Deepin) لنظام Linux Deepin [21] [22]
  • UKUI (واجهة مستخدم Ubuntu Kylin) [23] (Lightweight X11 Desktop Environment) ، بيئة سطح مكتب مصممة لـ TrueOS المستندة إلى BSD [24]
  • Lomiri (الوحدة 8 سابقًا) ، [25] بيئة سطح مكتب متقاربة بدأت بواسطة Canonical ، تحتفظ بها Ubports [26] ، غلاف سطح مكتب مكتوب بلغة Qt و Qml ، شوكة مطورة باستمرار على أساس KDE3 [27] ، مدير عرض هو X11 و Wayland متوافق مكتوب بلغة QML. (هذا مدير عرض وليس بيئة سطح مكتب.)

تحرير واجهات المستخدم المضمنة والمتنقلة

    تطويرها أو صيانتها بنشاط
      ، نظام تشغيل مفتوح المصدر مصمم للساعات الذكية ، نظام تشغيل محمول قائم على شاشة اللمس من شركة Blackberry Ltd. ، نظام تشغيل محمول طورته Jolla ، واجهة مستخدم رسومية تعمل باللمس تم تطويرها بواسطة KDE ، خليفة يحركها المجتمع لـ Palm / HP webOS ، استنادًا إلى Mer ، المعروفة سابقًا باسم Unity8 ، وهي واجهة مستخدم للهاتف طورتها Ubports ، في الأصل بواسطة Canonical in-car UI [28] ، وهو نظام تشغيل متعدد المهام من LG للأجهزة الذكية مثل أجهزة التلفزيون والساعات الذكية
      الهاتف والكمبيوتر اللوحي UX ، واجهة المستخدم الرسومية لـ Sharp Zaurus ، نظام من Nokia للأجهزة المدمجة والمحمولة

    التطبيقات التي تستخدم Qt Edit

    تستخدم العديد من البرامج مفتوحة المصدر أو الخاصة عبر الأنظمة الأساسية Qt أو QML:

      ، محرر سداسي عشري تجاري ومحرر نصوص لأنظمة Microsoft Windows و Linux و macOS. [29] [30]
    • تطبيق أداة سائق AMD's Radeon Software Crimson Edition. [31] ، مشغل موسيقى لأنظمة لينوكس ومايكروسوفت ويندوز وأنظمة تشغيل أخرى شبيهة بيونيكس. [32] [33] ، عميل بيتكوين ، محرر عميل بيتكوين كاش [34] ، محرر فيديو ، محاكي لأنظمة Nintendo Wii و Nintendo GameCube. برنامج التدوين [35] برنامج الرسوم المتحركة لإيقاف الحركة بواسطة CadSoft Computer / Autodesk ، وهو تطبيق EDA مع الالتقاط التخطيطي وتخطيط PCB والموجه التلقائي وميزات CAM
    • Electrum ، عميل بيتكوين خفيف الوزن ، بيئة حوسبة رقمية مفتوحة المصدر مجانية مفتوحة المصدر ، بيئة تطوير متكاملة [36]
    • Heimer ، خريطة ذهنية مفتوحة المصدر ، رسم بياني ، وأداة تدوين ملاحظات [37] ، برنامج لتحليل البيانات وتحرير الرسومات وبرامج الرسم الرقمي [38] ، برنامج إنتاج موسيقي متعدد المنصات ، برنامج حسابي رمزي رياضي ، يطلق عليه أحيانًا نظام أو برنامج جبر الكمبيوتر ، يستخدم في العديد من المجالات العلمية والهندسية والرياضية والحاسوبية. [39]
    • Moonlight Stream ، تطبيق مفتوح المصدر لـ Nvidia Shield [40] ، برنامج تدوين مفتوح المصدر ومتعدد المنصات ، مجموعة تعدين لبيانات برنامج screencast مجاني عبر الأنظمة الأساسية [41] عميل BitTorrent مجاني ومفتوح المصدر عبر الأنظمة الأساسية [42] نظام المعلومات الجغرافية [43] مسجل الصوت متعدد المسارات وبرنامج التحرير Feed Reader أداة إنشاء الألعاب المستخدمة في منصة Roblox. برنامج النشر المكتبي [44] برنامج التأليف الموسيقي والتدوين [45] أدوات المحرك [46] محرك ألعاب فيديو ثلاثي الأبعاد تم تطويره بواسطة Valve ، برنامج القبة السماوية ، وهو برنامج لتسجيل وتخطيط غطس السكوبا تم تصميمه وتطويره في البداية بواسطة Linus Torvalds [47] ، لغة بيئة وبرمجة لتركيب الصوت في الوقت الفعلي وتكوين الخوارزمية ، وحزمة برامج الكمبيوتر للتحكم عن بعد ، ومشاركة سطح المكتب ، والاجتماعات عبر الإنترنت ، وعقد المؤتمرات عبر الويب ونقل الملفات بين أجهزة الكمبيوتر [48] ، وهو عميل مراسلة متاح لأنظمة Windows و Mac Linux [49] برنامج ظاهرية OS [50] [51] ، محلل حزم [52] [53] ، زوم كسورية في الوقت الحقيقي [54]

    المنظمات التي تستخدم Qt Edit

    يتم استخدام Qt من قبل مجموعة واسعة من الشركات والمؤسسات مثل

    تحرير مفاهيم كيو تي

    تم بناء Qt على هذه المفاهيم الأساسية:

    التجريد الكامل لواجهة المستخدم الرسومية عند إصدارها لأول مرة ، استخدمت Qt محرك الطلاء وأدوات التحكم الخاصة بها ، محاكية مظهر الأنظمة الأساسية المختلفة التي تعمل عليها عند رسم عناصر واجهة المستخدم الخاصة بها. هذا جعل عمل النقل أسهل لأن عددًا قليلاً جدًا من الفصول في Qt يعتمد حقًا على النظام الأساسي المستهدف ، ومع ذلك ، فقد أدى ذلك أحيانًا إلى اختلافات طفيفة حيث كانت تلك المحاكاة غير كاملة. تستخدم الإصدارات الحديثة من Qt واجهات برمجة التطبيقات ذات النمط الأصلي للأنظمة الأساسية المختلفة ، على الأنظمة الأساسية التي تحتوي على مجموعة عناصر واجهة مستخدم أصلية ، للاستعلام عن المقاييس ورسم معظم عناصر التحكم ، ولا تعاني من مثل هذه المشكلات في كثير من الأحيان. [80] على بعض المنصات (مثل MeeGo و KDE) Qt هو واجهة برمجة التطبيقات الأصلية. اتخذت بعض مجموعات الأدوات الرسومية المحمولة الأخرى قرارات تصميم مختلفة على سبيل المثال ، تستخدم wxWidgets مجموعات أدوات النظام الأساسي المستهدف لعمليات تنفيذها. الإشارات والفتحات بنية لغة مقدمة في Qt للاتصال بين الكائنات [81] مما يجعل من السهل تنفيذ نمط المراقب مع تجنب الكود المعياري. المفهوم هو أن عناصر واجهة المستخدم الرسومية يمكن أن ترسل إشارات تحتوي على معلومات الأحداث التي يمكن أن تتلقاها عناصر التحكم الأخرى باستخدام وظائف خاصة تعرف باسم الفتحات. مترجم Metaobject يطلق على المترجم metaobject وزارة الخارجية، هي أداة يتم تشغيلها على مصادر برنامج Qt. يفسر وحدات ماكرو معينة من كود C ++ كتعليقات توضيحية ، ويستخدمها لإنشاء كود C ++ مضاف مع معلومات وصفية حول الفئات المستخدمة في البرنامج. يتم استخدام هذه المعلومات الوصفية بواسطة Qt لتوفير ميزات البرمجة غير المتوفرة أصلاً في C ++: الإشارات والفتحات ، والاستبطان واستدعاءات الوظائف غير المتزامنة. يمكن استخدام روابط اللغة Qt في العديد من لغات البرمجة بخلاف C ++ ، مثل Python و Javascript و C # و Rust [82] عبر ارتباطات اللغة العديد من اللغات لها ارتباطات لـ Qt 5 وارتباطات لـ Qt 4. تشتمل لغة برمجة Ring على Qt في مكتبة قياسية. [83] [84]

    وحدات كيو تي تحرير

    بدءًا من Qt 4.0 ، تم تقسيم الإطار إلى وحدات فردية. [85] [86] مع Qt 5.0 تم تشكيل الهيكل بشكل نمطي إلى أبعد من ذلك. [87] [88] Qt الآن مقسمة إلى أساسى و اضافه الوحدات. [89]

    أساسيات كيو تي تحرير

    وحدة وصف
    كيو تي كور وحدة Qt الوحيدة المطلوبة ، التي تحتوي على فئات مستخدمة من قبل الوحدات النمطية الأخرى ، بما في ذلك نظام meta-object ، والتزامن والترابط ، والحاويات ، ونظام الأحداث ، والمكونات الإضافية ومرافق الإدخال / الإخراج.
    كيو تي واجهة المستخدم الرسومية وحدة واجهة المستخدم الرسومية المركزية. في Qt 5 ، تعتمد هذه الوحدة الآن على OpenGL ، ولكنها لم تعد تحتوي على أي فئات عناصر واجهة مستخدم.
    الحاجيات كيو تي يحتوي على فئات لتطبيقات واجهة المستخدم الرسومية الكلاسيكية القائمة على عنصر واجهة المستخدم وفئات QSceneGraph. انشق عن QtGui في كيو تي 5.
    Qt QML وحدة للغات QML و JavaScript.
    كيو تي سريع وحدة تطبيق واجهة المستخدم الرسومية المكتوبة باستخدام QML2.
    كيو تي الضوابط السريعة القطعة مثل الضوابط ل كيو تي سريع مخصص بشكل أساسي لتطبيقات سطح المكتب.
    تخطيطات سريعة كيو تي تخطيطات لترتيب العناصر بتنسيق كيو تي سريع.
    شبكة كيو تي طبقة تجريد الشبكة. كاملة مع دعم TCP و UDP و HTTP و TLS و SSL (في Qt 4) و SPDY (منذ Qt 5.3).
    كيو تي الوسائط المتعددة فصول لوظائف الصوت والفيديو والراديو والكاميرا.
    أدوات الوسائط المتعددة كيو تي الحاجيات من كيو تي الوسائط المتعددة.
    كيو تي سكل يحتوي على فئات لتكامل قاعدة البيانات باستخدام SQL.
    كيو تي ويب إنجين مجموعة جديدة من Qt Widget و QML webview APIs استنادًا إلى Chromium.
    اختبار كيو تي دروس لوحدة اختبار تطبيقات Qt والمكتبات.

    إضافات كيو تي تحرير

    وحدة وصف
    نشط كيو تي فئات للتطبيقات التي تستخدم ActiveX.
    كيو تي بلوتوث الوصول إلى فئات أجهزة البلوتوث.
    كيو تي دي باص فئات IPC باستخدام بروتوكول D-Bus.
    كيو تي ان اف سي فئات الوصول إلى أجهزة NFC. مدعوم رسميًا فقط على أجهزة BlackBerry حتى الآن (أو N9 في منفذ MeeGo).
    كيو تي برنامج OpenGL تحتوي الوحدة النمطية القديمة على فئات OpenGL من Qt 4. في Qt 5 ، كانت الوظائف المماثلة في كيو تي واجهة المستخدم الرسومية موصى به.
    موقع كيو تي فئات الوصول إلى GPS وخدمات الموقع الأخرى ولرسم الخرائط والملاحة. انفصل عن وحدة التنقل Qt 4 الخاصة بـ موقع كيو تي. مدعوم على Android و BlackBerry و iOS و Linux (باستخدام GeoClue) و Windows و Sailfish OS.
    كيو تي النصي وحدة قديمة للبرمجة النصية لتطبيق Qt باستخدام ECMAScript / JavaScript. في Qt 5 ، باستخدام فئات مماثلة في Qt QML موصى به.
    حساسات كيو تي فئات الوصول إلى أجهزة استشعار الأجهزة المحمولة المختلفة. اعتاد أن يكون جزءًا من Qt Mobile في Qt 4. مدعوم على Android و BlackBerry و iOS و WinRT و Mer و Linux.
    منفذ كيو تي التسلسلي فئات للوصول إلى الأجهزة والمنافذ التسلسلية الافتراضية. مدعوم على أنظمة التشغيل Windows و Linux و macOS.
    Qt WebChannel يوفر الوصول إلى كائنات Qt إلى HTML / Js عبر WebSockets.
    كيو تي ويب كيت تطبيق Qt's WebKit وواجهة برمجة التطبيقات.
    أدوات Qt WebKit القطعة API لـ كيو تي ويب كيت
    كيو تي WebSockets يوفر تطبيق WebSocket.
    كيو تي إكس إم إل وحدة قديمة تحتوي على فئات لواجهات برمجة تطبيقات XML لنمط SAX و DOM. تم استبدالها بفئات QXmlStreamReader و QXmlStreamWriter بتنسيق كيو تي كور.
    أنماط Qt XML دعم التحقق من صحة مخطط XPath و XQuery و XSLT و XML.

    تحرير الإصدارات

    تتوفر أربعة إصدارات من Qt: تواصل اجتماعي, إندي موبايل, احترافي و مشروع. [90] إصدار المجتمع يخضع لتراخيص مفتوحة المصدر ، بينما إصدارات Indie Mobile و Professional و Enterprise ، والتي تحتوي على وظائف ومكتبات إضافية ، على سبيل المثال ضوابط Enterprise [90] تباع تجاريًا بواسطة شركة Qt.

    المنصات المدعومة تحرير

    تعمل Qt على العديد من المنصات المختلفة التي يتم دعمها رسميًا:

    برنامج وصف
    لينكس / يونكس
    X11 Qt for X Window System (Linux) [91] يتمتع كل من FreeBSD و NetBSD و OpenBSD و DragonFly BSD بدعم المجتمع.
    وايلاند يمكن لتطبيقات Qt التبديل بين الخلفيات الرسومية مثل X و Wayland في وقت التحميل باستخدام خيار سطر الأوامر -platform. [92] [93] يتيح ذلك الانتقال السلس لتطبيقات Qt من X11 إلى Wayland. يستخدم SailfishOS Wayland فقط لأنه لا يحتوي على X11. [94]
    ذكري المظهر Qt لنظام Android [95] (المعروف سابقًا باسم Necessitas). [96]
    لينكس مضمن Qt للمنصات المدمجة: المساعد الرقمي الشخصي ، الهاتف الذكي ، إلخ. [97] توجد كمنصات متعددة اعتمادًا على تقنية العرض. DirectFB و LinuxFB و EGLFS (شاشة كاملة EGL).
    منصات مايكروسوفت
    شبابيك Qt لنظام التشغيل Microsoft Windows 7 ، [98] 8 و 10 [99]
    نظام التشغيل Windows RT دعم تطبيقات Windows 10 Mobile المستندة إلى WinRT و Windows 10 IoT [100]
    منصات آبل
    macOS يدعم Qt لـ Apple macOS التطبيقات على Cocoa [101]
    iOS Qt لأنظمة iOS الأساسية (iPhone ، iPad) [102]
    المنصات الأخرى المضمنة
    التكامل كيو تي للنزاهة [103]
    QNX Qt for QNX [104] [105]
    VxWorks كيو تي ل VxWorks. [106] [107] متاح فقط بموجب ترخيص خاص (تجاري). كيو تي 5.5.

    بعد أن فتحت نوكيا كود المصدر Qt للمجتمع على Gitorious ، ظهرت منافذ مختلفة. هناك أيضًا بعض منافذ Qt التي قد تكون متاحة ، لكنها غير مدعومة بعد الآن. يتم سرد هذه الأنظمة الأساسية في قائمة الأنظمة الأساسية التي تدعمها Qt. انظر أيضًا هناك للحصول على دعم المجتمع الحالي للأنظمة الأساسية الأخرى الأقل شهرة ، مثل SailfishOS.

    تحرير الترخيص

    يتوفر Qt بموجب تراخيص البرامج المجانية التالية: [13] GPL 2.0 و GPL 3.0 و LGPL 3.0 و LGPL 2.1 (مع استثناء Qt الخاص). [5] [108] لاحظ أن بعض الوحدات متاحة فقط بموجب ترخيص GPL ، مما يعني أن التطبيقات التي ترتبط بهذه الوحدات يجب أن تتوافق مع هذا الترخيص. [109]

    بالإضافة إلى ذلك ، كانت Qt متاحة دائمًا بموجب ترخيص تجاري ، مثل ترخيص Qt التجاري ، [4] الذي يسمح بتطوير تطبيقات احتكارية بدون قيود على الترخيص.

    أدوات كيو تي تحرير

    تأتي Qt مع مجموعة الأدوات الخاصة بها لتسهيل التطوير عبر الأنظمة الأساسية ، والتي يمكن أن تكون مرهقة بسبب مجموعة مختلفة من أدوات التطوير.

    Qt Creator هو IDE متعدد المنصات لـ C ++ و QML. تم دمج وظائف تخطيط / تصميم Qt Designer في IDE ، على الرغم من أنه لا يزال من الممكن بدء Qt Designer كأداة قائمة بذاتها.

    بالإضافة إلى Qt Creator ، توفر Qt أداة qmake ، وهي أداة إنشاء نصوص متعددة المنصات تعمل على أتمتة إنشاء ملفات Makefiles لمشاريع التطوير عبر منصات مختلفة.هناك أدوات أخرى متاحة في Qt ، بما في ذلك منشئ واجهة Qt Designer ومتصفح مساعدة Qt Assistant (وكلاهما مضمن في Qt Creator) ، وأداة ترجمة Qt Linguist ، و uic (مترجم واجهة المستخدم) ، و moc (Meta-Object Compiler) ).

    التطورات المبكرة تحرير

    في صيف عام 1990 ، كان Haavard Nord و Eirik Chambe-Eng (المطوران الأصليان لـ Qt والمدير التنفيذي والرئيس ، على التوالي ، Trolltech) يعملان معًا على تطبيق قاعدة بيانات لصور الموجات فوق الصوتية المكتوبة بلغة C ++ وتعمل على Mac OS و Unix و Microsoft Windows. [1] [110] بدأوا تطوير "Qt" في عام 1991 ، قبل ثلاث سنوات من تأسيس الشركة تحت اسم Quasar Technologies ، ثم غيروا الاسم إلى Troll Tech ثم إلى Trolltech. [1]

    تم تسمية مجموعة الأدوات Qt لأن الحرف Q بدا جذابًا في محرف Emacs من Haavard ، و "t" مستوحى من Xt ، مجموعة أدوات X. [1]

    الإصداران الأولان من Qt لهما نكهتان فقط: Qt / X11 لـ Unix و Qt / Windows لنظام التشغيل Windows.

    في 20 مايو 1995 ، أصدرت Troll Tech علنًا Qt 0.90 لـ X11 / Linux مع كود المصدر تحت ترخيص Qt Free Edition. [111] [112] [113] تم اعتبار هذا الترخيص غير متوافق مع تعريف البرمجيات الحرة من قبل مؤسسة البرمجيات الحرة لأنه ، بينما كان المصدر متاحًا ، لم يسمح بإعادة توزيع النسخ المعدلة. استخدمت Trolltech هذا الترخيص حتى الإصدار 1.45. اندلع الجدل في عام 1998 تقريبًا عندما أصبح من الواضح أن بيئة سطح المكتب K ستصبح واحدة من بيئات سطح المكتب الرائدة لنظام Linux. نظرًا لأنه كان مبنيًا على Qt ، فإن العديد من الأشخاص في حركة البرمجيات الحرة قلقون من أن جزءًا أساسيًا من أحد أنظمة التشغيل الرئيسية الخاصة بهم سيكون ملكية.

    كان نظام Windows الأساسي متاحًا فقط بموجب ترخيص خاص ، مما يعني أنه لا يمكن نقل التطبيقات المجانية / مفتوحة المصدر المكتوبة في Qt لـ X11 إلى Windows دون شراء الإصدار الخاص.

    تصبح البرمجيات الحرة ودية تحرير

    مع إصدار الإصدار 2.0 من مجموعة الأدوات ، تم تغيير الترخيص إلى Q Public License (QPL) ، وهو ترخيص برمجيات حرة ، ولكن تعتبره مؤسسة البرمجيات الحرة غير متوافقة مع GPL. تم البحث عن حلول وسط بين KDE و Trolltech حيث لن تكون Qt قادرة على الخضوع لترخيص أكثر تقييدًا من QPL ، حتى لو تم شراء Trolltech أو أفلست. أدى ذلك إلى إنشاء مؤسسة KDE Free Qt ، [114] والتي تضمن أن Qt ستندرج تحت رخصة على غرار BSD في حالة عدم إصدار نسخة مجانية / مفتوحة المصدر من Qt خلال 12 شهرًا. [115] [116]

    في عام 2000 ، تم إصدار Qt / X11 2.2 بموجب GPL v2 ، [117] منهياً كل الجدل حول توافق GPL.

    في نهاية عام 2001 ، أصدرت Trolltech Qt 3.0 ، والذي أضاف دعمًا لنظام التشغيل Mac OS X (المعروف الآن باسم macOS). كان دعم Mac OS X متاحًا فقط في ترخيص الملكية حتى يونيو 2003 ، عندما أصدرت Trolltech Qt 3.2 مع دعم Mac OS X المتاح بموجب GPL.

    في عام 2002 ، بدأ أعضاء KDE في مشروع Cygwin في نقل قاعدة كود Qt / X11 المرخصة من GPL إلى Windows. [118] كان هذا ردًا على رفض Trolltech ترخيص Qt / Windows بموجب GPL على أساس أن Windows لم يكن منصة برمجيات مجانية / مفتوحة المصدر. [119] [120] حقق المشروع نجاحًا معقولًا على الرغم من أنه لم يصل أبدًا إلى جودة الإنتاج.

    تم حل هذه المشكلة عندما أصدرت Trolltech Qt 4.0 أيضًا لنظام التشغيل Windows بموجب GPL في يونيو 2005. [121] دعم Qt 4 نفس مجموعة الأنظمة الأساسية في إصدارات البرامج المجانية / مفتوحة المصدر كما هو الحال في إصدار الملكية ، لذا فمن الممكن ، باستخدام Qt 4.0 والإصدارات الأحدث ، لإنشاء تطبيقات مجانية / مفتوحة المصدر مرخصة من GPL باستخدام Qt على جميع الأنظمة الأساسية المدعومة. تمت إضافة GPL v3 مع استثناء خاص [122] لاحقًا كخيار ترخيص إضافي. يسمح استثناء GPL للتطبيق النهائي بالترخيص بموجب العديد من تراخيص البرامج الحرة / مفتوحة المصدر غير المتوافقة مع GPL مثل ترخيص Mozilla Public License 1.1.

    الاستحواذ بواسطة Nokia Edit

    استحوذت نوكيا على Trolltech ASA في 17 يونيو 2008 وغيرت الاسم أولاً إلى Qt Software ، ثم Qt Development Frameworks.

    ركزت نوكيا على تحويل Qt إلى منصة التطوير الرئيسية لأجهزتها ، بما في ذلك منفذ لمنصة Symbian S60. تم إصدار الإصدار 1.0 من Nokia Qt SDK في 23 يونيو 2010. [123] تم توفير كود المصدر عبر Gitorious ، وهو مستودع كود مصدر git موجه نحو المجتمع ، بهدف إنشاء مجتمع أوسع باستخدام Qt وتحسينه.

    في 14 يناير 2009 ، أضاف الإصدار 4.5 من Qt خيارًا آخر ، LGPL ، [124] لجعل Qt أكثر جاذبية لكل من المشاريع مفتوحة المصدر التي لا تتبع GPL والتطبيقات المغلقة. [125]

    في فبراير 2011 ، أعلنت نوكيا قرارها بإسقاط تقنيات Symbian وإقامة هواتفها الذكية المستقبلية على منصة Windows Phone بدلاً من ذلك (ومنذ ذلك الحين تم أيضًا إسقاط الدعم لهذا النظام الأساسي). [126] بعد شهر واحد ، أعلنت نوكيا عن بيع ترخيص Qt التجاري والخدمات الاحترافية لشركة Digia ، بهدف فوري هو الحصول على دعم Qt لمنصات Android و iOS و Windows 8 ، ومواصلة التركيز على تطوير سطح المكتب والتطوير المدمج ، على الرغم من أن Nokia كان أن تظل قوة التنمية الرئيسية وراء الإطار في ذلك الوقت.

    الدمج وفك الدمج باستخدام Digia Edit

    في مارس 2011 ، باعت Nokia جزء الترخيص التجاري من Qt إلى Digia ، مما أدى إلى إنشاء Qt Commercial. [127] في أغسطس 2012 ، أعلنت Digia أنها ستستحوذ على Qt من Nokia. [128] بدأ فريق Qt في Digia عمله في سبتمبر 2012. [129] قاموا بإصدار Qt 5.0 في غضون شهر وإصدارات أحدث كل ستة أشهر مع ميزات جديدة ومنصات مدعومة إضافية.

    في سبتمبر 2014 ، نقلت Digia أعمال Qt وحقوق التأليف والنشر إلى الشركة الفرعية المملوكة لها بالكامل ، The Qt Company ، التي تمتلك 25 علامة تجارية [130] مرتبطة بـ Qt. في مايو 2016 ، انفصلت Digia و Qt تمامًا في شركتين مستقلتين. [131]

    مشروع كيو تي والحوكمة المفتوحة تحرير

    تم إطلاق Qt 5 رسميًا في 19 ديسمبر 2012. يمثل هذا الإصدار الجديد تغييرًا كبيرًا في النظام الأساسي ، مع رسومات تسريع الأجهزة و QML و JavaScript يلعبان دورًا رئيسيًا. استمر دعم برامج C ++ التقليدية - QWidgets فقط ، لكنها لم تستفد من تحسينات الأداء المتاحة من خلال البنية الجديدة. [132] تقدم Qt 5 تحسينات كبيرة في سرعة وسهولة تطوير واجهات المستخدم. [133]

    انتقل تطوير إطار عمل Qt 5 إلى الحوكمة المفتوحة في qt-project.org ، مما أتاح للمطورين خارج Digia تقديم التصحيحات للمراجعة. [134]

    كيو تي المساهمين تحرير

    بصرف النظر عن شركة Qt ، يشارك العديد من المنظمات والأفراد الذين يستخدمون Qt كمنصة تطوير خاصة بهم في التطوير المفتوح لـ Qt عبر مشروع Qt. [135]

    أحد المساهمين في Qt هو Klarälvdalens Datakonsult AB ، وهي شركة استشارات سويدية من Qt. [136] تشترك KDAB في العديد من المجالات ، بما في ذلك صيانة العديد من المكونات. [137] [138]

    جنبا إلى جنب مع RIM / BlackBerry ، تحافظ KDAB على منافذ QNX و BlackBerry 10 من Qt. [135] [139]

    مشارك آخر هو Intel ، يساهم على سبيل المثال في دعم Wayland. [140] تحافظ أكواد الصوت على دعم IBM ClearCase في Qt Creator. [141]

    كمستخدم ثقيل لـ Qt ، يرسل مشروع KDE العديد من التصحيحات والميزات من مكتبة المطورين KDE Frameworks إلى Qt. [142]

    يوفر Qt Wiki قائمة شاملة بالكتب الإنجليزية حول Qt. [143] هذه قائمة من الكتب البارزة:


    مقدمة

    يُنظر إلى الكهربة المتوقعة للتنقل كخطوة كبيرة في الزيادة التدريجية لاستدامتها. وفقًا للوكالة الدولية للطاقة ، فإن تحقيق هدف زيادة درجة الحرارة العالمية بمقدار درجتين كحد أقصى الذي حددته اتفاقية باريس يعني أنه ينبغي تحقيق ما يقرب من 19٪ من انبعاثات غازات الدفيئة من خلال التخفيف من انبعاثات النقل. بالإضافة إلى ذلك ، مع زيادة التحضر في السنوات القادمة ، ستلعب الحركية الكهربائية ، خاصة في المناطق الحضرية الكبيرة مثل المدن الكبرى ، دورًا أساسيًا 1. في الواقع ، في عام 2011 ، بلغت حصة العالم من البنزين للتنقل في 27 مدينة عملاقة حوالي 9٪ ، ومن المتوقع أن تزيد هذه الحصة 2،3 أكثر. وبالتالي ، من المتوقع زيادة انبعاثات غازات الدفيئة وتلوث الهواء ، فضلاً عن الاعتماد المتزايد على استيراد الوقود.

    ولذلك ، فإن استخدام أنواع بديلة وصديقة للبيئة من الوقود وقطارات الطاقة هي استراتيجية رئيسية للتوجه نحو أنظمة النقل المستدامة ، وإلى جانب المركبات الكهربائية (EV) ، تعتبر مصادر الطاقة المتجددة استراتيجية ناجحة أخرى لتقليل انبعاثات غازات الدفيئة من المدن. نظرًا لأنه من المتوقع أن يزداد عدد المركبات الكهربائية ، نظرًا للعدد الكبير المحتمل من المركبات المعنية ، سيكون التخطيط والتحكم الموثوق به في البنية التحتية للشحن أمرًا أساسيًا لتحقيق التكامل الناجح في نظام الطاقة. على وجه الخصوص ، يجب أن يعتمد الحجم الصحيح للموارد المطلوبة ، من الكهرباء ومحطات الشحن والبنى التحتية للاتصالات والإدارة ، على احتياجات التنقل المحلي وعلى كل من البنية التحتية للتوزيع وقيود سوق الكهرباء 4. في الواقع ، تحتاج البنى التحتية للكهرباء ، لعقود من الزمن على أساس نموذج هرمي قائم على الأحفوري للإنتاج والتوزيع ، إلى الاستعاضة عنها بنموذج جديد مرن للتوليد والتوزيع تستند أسسها الصلبة إلى مصادر الطاقة المتجددة والتكامل واللامركزية. بالإضافة إلى ذلك ، بفضل المستوى المتزايد لرقمنة البنى التحتية ، يعد التكامل بين التوليد الموزع والتنقل الكهربائي ذا فائدة كبيرة. إذا تم التخطيط جيدًا ، يمكن أن يساهم في وقت واحد في الحد من الانبعاثات وفي مرونة الشبكة نظرًا لقدرة المركبات الكهربائية على العمل كمخزن موزع لتثبيت تقلبات الطاقة على أنظمة الكهرباء الموزعة 5،6،7.

    فيما يتعلق بمبادرات التنقل الكهربائي ، تركز الأدبيات الحالية 8،9،10 بشكل أساسي على تقييم تأثير البنية التحتية للتنقل الكهربائي على نطاق العاصمة. هذا لا يأخذ في الاعتبار التأثيرات بعيدة المدى على كل من البنية التحتية للتنقل والشبكة. في الواقع ، يمكن أن يؤثر الاختراق العالي للمركبات الكهربائية في المناطق المكتظة بالسكان على نظام نقل الكهرباء المحيط ، مما يؤدي إلى تأثيرات نظامية يصعب تحديدها من خلال قصر التحليل على حدود المدينة الوحيدة.

    في هذه الورقة ، يتم تقديم نهج متعدد الطبقات يعتمد على نظرية الشبكات المعقدة 11 ، 12 ، 13. ندرس التعايش بين طبقتين مختلفتين للبنية التحتية للشبكة ، الطاقة والتنقل ، لتقدير تأثير التنقل الكهربائي على نطاق إقليمي ، بهدف تحديد التأثيرات قصيرة المدى وطويلة المدى. سمحت المنهجية المقترحة بإجراء تحليل مقياس يأخذ في الاعتبار مخطط البنية التحتية متعدد الطبقات للمشكلة. يستغل النهج المقترح بيانات التعداد فيما يتعلق بالتنقل لتقدير مصفوفة الأصل والوجهة لرحلات المركبات الكهربائية. يعد التنقل أمرًا مهمًا بشكل خاص لتنقل المركبات الكهربائية ، لأنه يتكون من رحلات قصيرة ومتوسطة المدى ، والتي تتكامل بشكل جيد مع النطاقات المحدودة من المركبات الكهربائية. علاوة على ذلك ، تعتمد المنهجية المقترحة على خريطة محطات توليد الطاقة الشمسية وطاقة الرياح لتحديد البلديات القادرة على إنتاج الكهرباء منخفضة الكربون لدعم تنقل المركبات الكهربائية على نطاق إقليمي. باستخدام مجموعتي البيانات المختلفتين هاتين ، من الممكن تقدير احتياجات الطاقة لخدمات الشحن في كل من المدن والطرق السريعة ، بالإضافة إلى التحقق من التكامل المحتمل مع الشبكة المحلية ومحطات توليد الطاقة المتجددة.

    يتم تنفيذ التخطيط المقترح للتنقل الكهربائي على مستويات مختلفة ، وفقًا لتوافر البيانات (بما في ذلك التعداد وشبكة التنقل ومحطات التوليد المركبة). يتم ترتيبها في ثلاث خطوات:

    جمع البيانات والمراجع الجغرافية عن طريق نظم المعلومات الجغرافية (GIS).

    تعريف النظام المعقد القادر على وصف التفاعل المتوقع بين التنقل وشبكات الطاقة. يتضمن النهج المقترح أيضًا تقدير تدفقات المرور المتوقعة بدءًا من بيانات التنقل في التعداد ، ودمجها في وصف الطاقة للمركبات الكهربائية.

    تحديد التفاعلات بين طبقات النظام لتحديد تأثير احتياجات الطاقة للتنقل على شبكة الطاقة في المنطقة ، من حيث تدفقات الطاقة المرتبطة بها.


    مناقشة

    هدفت هذه الدراسة إلى تسجيل أنواع القراد التي تتغذى على حيوانات الومبت عارية الأنف والتعرف على البكتيريا المرتبطة بها. تم جمع خمسة أنواع من القراد وتضمين السجل الأول لـ حاء لونجيكورنيس على الومبتات عاريات الأنف. تم اكتشاف عدد كبير جدًا من التسلسلات البكتيرية في قراد الومبت ، مما يبرز فعالية NGS وتنوع الكائنات الحية الدقيقة في القراد الأسترالي. سيطرت البكتيريا المتقلبة والشعيات والبكتيريا الشعاعية على المظهر البكتيرية ، كما أن التركيب البكتيري للقراد المدروس يدعم إجراء تحقيقات مماثلة في هذه الأنواع [14 ، 17 ، 29].

    قراد الومبت B. auruginans هو القراد الأكثر انتشارًا على الومبت عاري الأنف [46،47،48] ، وتم تمثيل جميع الأطوار باستثناء اليرقات في هذه الدراسة. تم تحديد جميع عينات اليرقات التي تم جمعها على أنها بوثريوكروتون ص. وشاركوا مضيفهم مع فقط B. auruginans الأطوار. من المحتمل أن تكون هذه العينات اليرقية B. auruginans بسبب خصوصية مضيف أخرى بوثريوكروتون النيابة. ومع ذلك ، لا يمكن تأكيد ذلك. ارتبطت الإصابة الشديدة بالقراد بفقر الدم والمعايير الصحية الضعيفة في الجرابيات المحلية الأخرى [49 ، 50] ، وتم تشخيص اثنين على الأقل من الومبات في هذه الدراسة بفقر الدم نتيجة عبء القراد (D. Kerr ، التواصل الشخصي ). بينما اقترح أن B. auruginans يحدث في معظم مناطق الومبت عارية الأنف في نيو ساوث ويلز [51] ، والمواقع المؤكدة الوحيدة في الولاية هي بوراوانج [46] وتولوم وأرميدال [30] ووي جاسبر [17]. توفر هذه الدراسة تقارير محلية إضافية لـ B. auruginans ويسلط الضوء على وفرة هذا النوع على الومبت عارية الأنف. على الرغم من خصوصية المضيف B. auruginans، فقد تم اقتراح أنه من المحتمل أن يكون علامة مكونة من ثلاثة مضيفات مثل غيرها بوثريوكروتون sp. ، التي تتطفل على الزواحف [30] ومع ذلك ، هناك حاجة إلى مزيد من البحث حول دورة حياة وموسمية هذا النوع.

    يُعرف باسم قراد الأدغال في أستراليا وقراد الماشية أو القراد الآسيوي طويل القرون في مكان آخر ، حاء لونجيكورنيس هو قراد تم إدخاله مكون من ثلاثة مضيفات يتم توزيعه من جنوب شرق كوينزلاند إلى فيكتوريا [52]. سجل القراد الجديد للومبات عارية الأنف ، تم تمييز قراد الأدغال الذي تم جمعه في هذه الدراسة بشكل إيجابي عن الأنواع المماثلة من خلال أسنان 5 + 5 وتوتنهام مدبب بشكل حاد على كوكسا 1 [30]. يعتبر قراد الأدغال الذكر البالغ الموجود في Coolagolite NSW أمرًا غير معتاد بشكل خاص نظرًا لأن هذا النوع من الكائنات الفطرية الملزمة في أستراليا ، مما يؤدي إلى ندرة وجود الذكور [53]. تعتبر الماشية والأغنام والخيول هي المضيف المفضل لهذا النوع ، ولكن تم جمعها أيضًا من البشر والحيوانات الأليفة وأنواع مختلفة من الطيور والولب مخطط أسود (والابيا الظهرانية) ، بانديكوتس الشمالية البني (Isoodon macrourus) والولارو المشترك (Macropus robustus) [30 ، 31]. كانت العينات الثلاث التي تم جمعها في هذه الدراسة من حيوان الومبت الحر على أرض مساحتها 100 فدان بدون ماشية نشطة ، ومع ذلك ، يمكن الوصول إلى الممتلكات مع الماشية عبر أسرة الخور المجففة في أوقات معينة من العام (D. Ondinea ، الاتصال الشخصي ). تمت دراسة قراد الأدغال على نطاق واسع في الخارج ويعتبر ناقلًا للبكتيريا والفيروسات والطفيليات على وجه الخصوص C. burnetii [54], إرليشيا شافينسيس, بوريليا النيابة. [55] و Theileria orientalis [56] ومع ذلك ، لم يظهر انتقال العدوى في العينات الأسترالية [57].

    تشتهر قرادة الشلل الأسترالية بأنها تسبب شلل القراد في الحيوانات الأليفة والبشر [58]. ومع ذلك ، فقد تطورت الجرابيات الأسترالية الأصلية والجرابيات الأسترالية بشكل مشترك مع قراد الشلل الأسترالي ، وهما المضيفان الطبيعيان لهذا القراد وعادةً ما يكونان محصنين ضد شلل القراد [59]. تم العثور على قراد الشلل الأسترالي على طول الساحل الشرقي بأكمله لأستراليا ، وهو عبارة عن مغذي انتقائي وقد تم العثور عليه في العديد من أنواع الطيور والثدييات المختلفة ، ومع ذلك ، فإنه يعتمد في مناطق معينة على العصابات للبقاء على قيد الحياة بين المواسم [30]. كانت جميع العينات التي تم جمعها في هذه الدراسة من الإناث المحتقنة ، ومع ذلك ، نادرًا ما يُنظر إلى الذكور البالغين ، حيث يحدث التزاوج خارج المضيف ويتغذى القراد البالغ على أنثى القراد مقارنةً بالثدييات المضيفة [60]. مع استخدام البرايمر الحجب المستهدفة ، فإن الحمى العاكسة بوريليا ص. تم عزله مؤخرًا من قراد شلل أسترالي واحد تم جمعه من إيكيدنا [13] ، مما يبرز القدرة الممرضة الخفية لهذا النوع.

    مثل قراد الشلل الأسترالي ، فإن القراد الجرابي الشائع عشوائي بالمثل في عاداته الغذائية التي تم العثور عليها في العديد من الحيوانات البرية والحيوانات الأليفة والبشر. ومع ذلك ، فهو الأكثر انتشارًا Ixodes الأنواع في أستراليا وقد ارتبطت بمسببات الأمراض المختلفة مثل ريكتسيا, ريكيتسييلا, بارتونيلا, ثيليرياوالديدان الخيطية و هيباتوزون [29، 61،62،63،64،65،66]. توجد بانتظام في الومبات عاريات الأنف وبأعداد قليلة [48 ، 67] ، أنا تسماني هو نوع لطيف ينفصل عن مضيفيه الفقاريات الليلي أثناء النهار ، وبالتالي من المحتمل أن يكون مرتبطًا بجحور الومبت. نظرًا لمعدل التكاثر السريع ودورة الحياة المكونة من ثلاثة مضيفات وتنوع الكائنات المسببة للأمراض التي تأويها عادةً ، فمن المحتمل أن تشكل هذه الأنواع تهديدًا للمرض على الومبتات ومعاملي الومبت ، ومع ذلك ، يجب إجراء المزيد من الأبحاث لتحديد مدى هذا تهديد.

    القراد المستوطن الذي يتغذى بشكل أساسي على macropods ، يتم توزيع قراد الولاب في الغالب في جميع أنحاء كوينزلاند الساحلية وشمال نيو ساوث ويلز ، وبصرف النظر عن السكان المنفصلين في جزيرة ريموند فيكتوريا ، فإن التقارير الواقعة في أقصى الجنوب عن هذا النوع من حيوان الومبت عاري الأنف ، وهو أحمر العنق والابي (Macropus rufogriseus) و ولب المستنقع (والابيا ثنائي اللون) في غابة ولاية Nadgee في نيو ساوث ويلز [24]. كانت العينات التي تم جمعها في هذه الدراسة من Dalgety و Quaama NSW ، والتي تقع على بعد ساعتين تقريبًا شمال Nadgee. تؤكد هذه العينات الجديدة أيضًا وجود قراد الولب في أقصى جنوب منطقة نيو ساوث ويلز وتقدم الحساب الثاني لهذا النوع الذي يتغذى على حيوانات الومبت عارية الأنف [24]. على الرغم من أن macropods هي المضيف الأصلي لـ H. بانكروفتى، هناك سجلات لهذا النوع من الماشية أكثر من الحيوانات المحلية [24] ، وهو أحد النواقل الرئيسية لـ ت. أورينتاليس التي تؤثر على الماشية في أستراليا [57 ، 68].

    تحليل تنوع ألفا (الشكل.6) أظهرت تباينًا كبيرًا عبر مواقع العينات والأعمار ، على غرار الدراسات السابقة [17 ، 69]. ومع ذلك ، كان هناك بعض التشابه بين نفس الأطوار من نفس موقع المجموعة. يمكن أن يختلف التنوع اختلافًا كبيرًا بين دراسات القراد اعتمادًا على طرق الاستخراج وجودة التصفية وتحليل المعلومات الحيوية. خضعت جميع العينات في هذه الدراسة لاستخراج متطابق ، وإعداد مكتبة ، وتحليل للمعلومات الحيوية ، لذا فمن المحتمل أن يؤثر ذلك على عمق تسلسل العينات. لقد لوحظ أنه بالنسبة لبعض أنواع القراد المحلي ، بما في ذلك قراد الومبت ، هناك حاجة لعدد أكبر من التسلسلات لإنتاج تمثيل دقيق للتنوع البكتيري [17]. كانت طائفة البروتيوباكتيريا هي الأكثر وفرة وتنوعًا ، والتي تتوافق مع دراسات مماثلة للقراد الصلب الأصلي [29 ، 70].

    تنوع ألفا للتكوين البكتيري في القراد الذي تم جمعه من الومبت العارية الأنف (خامسا أورسينوس) بين يناير 2019 ويناير 2020 مقيَّمًا بالتنوع (شانون ، سيمبسون) والثراء (ACE ، معكوس سيمبسون)

    تم عزل مسببات الأمراض سابقًا من B. auruginans تضمن C. burnetii, ريكتسيا ماسيليا و الريكتسيا التيفية [29] ومستويات متفاوتة من المتقلبات والبكتيريا القوية [14 ، 17]. معدل الانتشار المرتفع للغاية لـ C. burnetii وجدت في الكل B. auruginans تتشابه الأطوار في هذه الدراسة مع النتائج السابقة في هذا النوع [29]. كوكسيلامن المعروف أن الكائنات الحية الشبيهة بكفاءة عالية في الانتقال عبر المبيض بين مضيفات القراد [71] ، وقد يوحي وجودها داخل أنابيب Malpighian بأنها تلعب دورًا في تغذية القراد [7]. سلالات مختلفة من C. burnetii تم إثبات ارتباطه الوثيق (& gt 99٪) استنادًا إلى 16S rRNA ، مما يبرز أن الأنواع تطورت مؤخرًا من تعايش أسلاف القراد [6]. لأن B. auruginans يُظهر مثل هذه الخصوصية الرائعة للمضيف ، فمن غير المحتمل أن يكون هذا النوع ناقلًا مهمًا لـ C. burnetii في البشر. ومع ذلك ، من غير المعروف ما هو تأثير هذا العامل الممرض على كل من الومبتات السليمة والمتضررة من الجرب. فشلت عينات الدم والبول المأخوذة من الومبت في الإشارة إلى وجود الـ C. burnetii [72] ، في حين أن الجرابيات المحلية الأخرى مثل الكوالا وعصابات الأرجل و macropods وُجد أنها إيجابية مصلية لهذه البكتيريا [73 ، 74 ، 75]. مزيد من الدراسات للتحقيق في وجود C. burnetii في براز ودم الومبت وفي طفيليات أخرى غير B. auruginans، قد يكون مفيدًا لتحديد أهمية ودور وتأثير هذا العامل الممرض في الومبت وقراد الومبت.

    حضور ال بوريليا في القراد الأسترالي هو اكتشاف حديث [13] ، وقد وفرت المناهج المستهدفة باستخدام حجب البادئات وجينات التدبير المنزلي المحفوظة للغاية نظرة ثاقبة للخزانات المحتملة وناقلات الرواية بوريليا ص. في أستراليا [14]. وهناك نوع من بوريليا كان أقرب مباراة إلى Candidatus بوريليا إيفورينسيس وتم اكتشافه في ملف بوثريوكروتون أوروجينان من نيو ساوث ويلز. كانت العزلة الأصلية لهذا النوع من Amblyomma variegatum في غرب إفريقيا ، وهي أكثر ارتباطًا بالحمى الراجعة بوريليا مجموعة من مجموعة لايم [76]. غير المثقفين أنابلازما ص. تم عزله أصلاً من قراد إيكيدنا (كونكلور بوثريوكروتون). كل المعترف بها أنابلازما النيابة. هي مُمْرِضات تنتقل عن طريق القراد داخل الخلايا [77] ، وبما أن الانتقال عبر المبيض بين القراد لم يتم إثباته بعد ، يُعتقد أن هذا الجنس يستمر فقط من خلال مضيفات ثدييات مصابة بالعدوى [78].

    جرثومة متعايشة في الجهاز الهضمي للثدييات ، بكتريا قولونية توجد بشكل شائع في الثدييات المحلية ، مع أعلى معدل انتشار في الثدييات العاشبة ذات كتل الجسم الأكبر [79]. بعض أنواع بكتريا قولونية هي حيوانية المصدر وتؤثر على صحة الإنسان [80]. وجدت إحدى الدراسات أن حيوانات الومبت الشمالية ذات الأنف المشعر (لاسيورهينوس كريفتي) أن يكون لديك بكتريا قولونية انتشار 80٪ والومبات الجنوبية مشعر الأنف (لاتيفرونس Lasiorhinus) لديها 86٪ [79] ومع ذلك ، وجدت دراسة أخرى عدم وجود حيوانات حيوانية بكتريا قولونية في جميع أنواع الومبت الثلاثة [81]. بينما سلالة بكتريا قولونية يحدث في B. auruginans، فقد ثبت أن القراد يظهر استجابات مناعية فطرية مختلفة لهذه البكتيريا [82 ، 83] ويتم تدميرها في جسم القراد بدلاً من إيواؤها ونقلها.

    غالبًا ما نجد أن القراد يحتوي على كميات كبيرة من البكتيريا المرتبطة ببيئات التربة التي يقضون فيها معظم حياتهم ، بالإضافة إلى البكتيريا المرتبطة بجلد مضيفيهم من الثدييات [13 ، 84]. قد يكون لبعض البكتيريا المسببة للأمراض والمرتبطة بالجلد والتي تم اكتشافها في كل من قراد الومبت والقراد الجرابي الشائع تداعيات محتملة على الومبت المصابة بالجرب القارمي ، أو حتى يمكن اكتشافها نتيجة لتغذية القراد على الومبت مع قراد جرابي مرتبط بالجرب. بكتيريا.

    أعضاء الجنس المكورات العنقودية عادة ما تكون متكافئة من جلد الثدييات ، وتوجد بشكل شائع في قراد الحياة البرية الأسترالية الأصلية [84 ، 85] بعض الأنواع مثل المكورات العنقودية الذهبية وترتبط مع Sarcoptes scabiei العث ومسؤول عن التسبب في تقيح الجلد المصاحب للجرب في البشر [86]. نوعان من المكورات العنقودية تم الكشف عنها في هذه الدراسة: S. agnetis، والذي يرتبط عادةً بالأمراض السريرية في الماشية والدواجن [87 ، 88] ، و S. sciuri، وهي بكتيريا مرتبطة بالجلد يتم الحصول عليها من خلال ملامسة الجلد المضيف [84]. المكورات العنقودية sciuri تم اكتشافه أيضًا في براغيث من العصابات والكلاب في أستراليا ، وفي أنواع مختلفة من القمل والقراد I. هولوسيكلس و حاء لونجيكورنيس [85].

    تم العثور على مزيد من البكتيريا ذات الصلة بالجلد C. القرحة، الذي يسبب عدوى حيوانية المصدر تشبه الدفتيريا [88] ، Dolosigranulum pigrum، والذي يرتبط بالالتهاب الرئوي عند البشر [89 ، 90] ، و مكروكوس برونينسيس، وهو مشابه نسبيًا لأنواع مكروكوس مسؤول عن التسبب في عدوى جلدية في الكلاب [91]. ما لا يقل عن ثلاثة أنواع متميزة من العقدية تم الكشف عنها ، منها S. dysgalactiae و S. ديدلفيس من مسببات الأمراض المهمة للإنسان والحيوان المسببة للعدوى الجلدية [92 ، 93]. أنواع أخرى من العقدية مثل الأبراج العقدية من عند Sarcoptes scabiei العث هو المسؤول عن التسبب في عدوى الجلد لدى البشر [86]. قد تكون الإمراضية وعواقب هذه البكتيريا المصاحبة للجلد على كل من الومبتات الصحية والمتضررة من الجرب مهمة.

    تعد البكتيريا التكافلية الداخلية مكونًا مهمًا من ميكروبيوم القراد وغالبًا ما تلعب دورًا في اللياقة الإنجابية والتغذوية للقراد [15]. تشمل التعايش الداخلي للقراد الموجود في هذه الدراسة ريكيتسييلا, Acinetobacter و الزائفة. الجنس Acinetobacter و الزائفة تم عزلها سابقًا عن براغيث الومبت [85] وتوجد أيضًا في الكل Ixodes تم فحصه ويعتقد أنه يلعب دورًا مهمًا في العمليات الفسيولوجية للقراد [93]. بالرغم من أنا تسماني تظهر نسبة انتشار عالية جدًا لـ a ريكيتسييلا التعايش الداخلي ، بعض المتعايشين الداخليين للقراد المعروف مثل Wolbachia و فرانسيسيلا لم يتم الكشف عنها في هذه الدراسة.

    يُعتقد أن التعايش الداخلي البكتيري هو السائد في غالبية قراد ixodid [9] ، وهناك أمثلة على بكتيريا تعايش جواني بكثرة لدرجة أنها تخفي الميكروبات الأخرى بما في ذلك مسببات الأمراض ، على سبيل المثال Candidatus ميديكلوريا ميتوكوندري في قراد الشلل الاسترالي [13]. سيحتوي الحمض النووي المستخرج من عينات القراد الكاملة ، ولا سيما تلك التي تتغذى من مضيفي الفقاريات ، على الحمض النووي للقراد ، والحمض النووي المضيف ، والحمض النووي الميكروبي (أي البكتيريا ، والفيروسات ، وحقيقية النواة). من المعروف أن وجود الحمض النووي للمضيف في القراد المحتقن يسبب صعوبات بسبب الخصائص المثبطة في دم الثدييات [94] ، لذلك يلزم اتباع نهج هادف عند فحص المجتمعات البكتيرية. تشمل الواسمات الجينية الشائعة المستخدمة في التحديد الجزيئي للقراد والبكتيريا المرتبطة بها السيتوكروم ج جينات ترميز البروتين للوحدة الفرعية 1 (COI) من أوكسيديز ، وجينات الرنا الريباسي 16S و 12S rRNA و 18S rRNA [94]. لكل منها مزاياها وقيودها ، على سبيل المثال ، تقدم COI مكتبة حالية واسعة من البادئات العالمية لأنها العلامة القياسية للترميز الشريطي لأنواع الحيوانات ، ومع ذلك ، فهي محدودة في قدرتها على التمييز بين مجموعات معينة من الكائنات الحية مثل Ixodidae إلى مستوى الأنواع . يعتبر جين الرنا الريباسي 16S هو الواسم الجزيئي الأكثر استخدامًا لأنه يمكن أن يميز بدقة بين معظم الأصناف بدائية النواة ، ولكن قد يكون من الصعب تمييز بعض المجموعات الميكروبية مثل Rickettsiales بسبب تشابهها بين الأنواع 16S rRNA [95]. هناك تسع مناطق متغيرة للغاية من جينات الرنا الريباسي 16S البكتيرية التي يمكن استهدافها بشكل فعال لتحديد الأصناف البكتيرية (V1-V9) ، وقد تم استخدام المناطق V1-V4 بشكل شائع في القراد [15].

    كانت طريقة أخذ العينات المستخدمة في هذه الدراسة اقتصادية ويسمح بإجراء تقييم عادل لمعدلات الإصابة بالقراد على مضيفات الومبات. ومع ذلك ، يمكن الافتراض أنه في بعض الحالات من المحتمل التغاضي عن الأطوار الصغيرة من القراد الحوري واليرقي. من المحتمل أيضًا أن تكون بعض القراد قد تركت حيوانات قتل على الطريق تم أخذ عينات منها بشكل انتهازي ، على الرغم من Skerratt et al. [48] ​​لا يوجد فرق بين كثافة القراد على حيوانات الومبت الحية أو المقتولة على الطرق. من المحتمل أن تشير الوفرة العالية من الأطوار الأنثوية إلى بعض التحيز في المجموعة نظرًا لحجمها الأكبر. يحد جمع القراد من الحيوانات الخاضعة للرعاية من تقييم أصل أنواع القراد وأنواع الكائنات الحية الدقيقة بسبب عدم اليقين فيما إذا كانت القراد تعلق في موقع إعادة التأهيل أو الموطن الأصلي الذي تم جمع الومبات منه. لا يمكن معالجة ثلاثة أنواع من القراد التي تم جمعها من الومبت (الولب والأدغال وقراد الشلل الأسترالي) لوجود البكتيريا في هذه الدراسة. ومع ذلك ، فإن هذه الأنواع من القراد هي ناقلات معروفة لمسببات الأمراض الهامة للحيوانات الأليفة والبشر ، ونتيجة لذلك تمت دراستها على نطاق واسع. كانت جميع القراد التي تم جمعها في هذه الدراسة باستثناء قراد الشلل الأسترالي عبارة عن قراد صلبة غير مخدرة ويفترض أن مضيفي الومبت قد التقطوها أثناء الرعي. العديد من الومبات المستخدمة في هذه الدراسة كانت أيضًا في بيئة غير نمطية ولم تتعرض مؤخرًا للجحور. بالنظر إلى أن غالبية القراد الناعم لطيف ويتغذى لفترات قصيرة جدًا من الوقت ، فإن المزيد من التحقيق في القراد المرتبط بجحور الومبت سيوفر منظورًا أوسع لجميع أنواع القراد المرتبطة بالومبات.


    2 وصف برنامج العمل

    2.1 الأهداف

    كان الهدف الأول لبرنامج العمل هو "التعلم بالممارسة" للزميل في منهجية تقييم مخاطر سلامة الأغذية ، بما في ذلك جمع البيانات وتطبيعها وتحليلها والمشاركة في تطوير والتحقق من صحة مجموعة من أدوات تقييم المخاطر الوبائية. استنادًا إلى التصنيف الجزيئي و WGS لـ كامبيلوباكتر jejuni الجينوم.

    • WP1. تنظيم البيانات: يركز على مراجعة الأدبيات ، وجمع البيانات الأولية المتاحة ، وتحليل وتطبيع وتنظيم البيانات من أجل التحليلات الوبائية اللاحقة.
    • WP2. تحليلات الكتلة والجمعيات: بهدف فهم واكتساب المهارات العملية في المعلوماتية الحيوية ، التعرف على الأدوات المستخدمة في المعلوماتية الحيوية ، والتدريب من خلال القيام بمختلف الأساليب والأساليب الإحصائية لتحليل البيانات.
    • WP3. تطوير نماذج تقييم المخاطر: من خلال المشاركة في تطوير والتحقق من صحة مجموعة من نماذج تقييم المخاطر مع الأخذ في الاعتبار الرئيسي ج. jejuni الأنماط الجينية وتقدير مساهمتها في التعرض الكامل للمستهلكين من إيطاليا.

    الهدف الثاني هو تعزيز العلاقات بين المنزل والمنظمة المضيفة. IZSAM هو مركز مرجعي لمنظمة الأغذية والزراعة لعلم الأوبئة البيطرية ومركز متعاون مع OIE للتدريب البيطري وعلم الأوبئة وسلامة الأغذية ورعاية الحيوان ، وتم النظر في إيجاد حل للاتفاق والتعاون بين المنظمات.

    كان الزميل جزءًا من فريق COVEPI المشارك في أنشطة برنامج العمل هذا. على وجه الخصوص ، كان اثنان من كبار علماء الأوبئة وخبير الإحصاء جزءًا من الفريق ، الذي عمل عن كثب مع خبراء المعلومات الحيوية في GENPAT ، وموظفي NRL من أجل كامبيلوباكتر. قام اثنان من كبار علماء الأوبئة في فريق COVEPI بدور المرشدين للزميل ، حيث ساعدوه يوميًا خلال جميع الأنشطة التي تم تنفيذها. تم عقد اجتماع تنسيقي بين الزميل والمعلم والمشرف بانتظام ، على أساس أسبوعي ، للتحقق من العمل المنجز ومناقشة الآثار المترتبة على النتائج التي تم الحصول عليها والتخطيط للأنشطة اللاحقة. عمل الزميل على وجه التحديد على تحليل البيانات الناتجة عن الكتابة الجزيئية لـ C. jejuni، وفي تطوير واختبار والتحقق من صحة الأدوات المختلفة لتحديد التجمعات الزمانية المكانية ذات الأهمية الوبائية. تابع الزميل عملية إنتاج البيانات ومعالجتها بالكامل ، من أنشطة التسلسل ، التي أجريت في المختبر إلى تحليلات المعلوماتية الحيوية والتحليلات الإحصائية التي أجريت على بيانات التسلسل. بالإضافة إلى ذلك ، استفاد الزميل بشكل كبير من مشاركة IZSAM في أنشطة مشروع COHESIVE ، مع مشاركته في اجتماعات المشروع المختارة.

    2.2 الأنشطة / الأساليب

    2.2.1 WP1. تنظيم البيانات

    في البداية ، تم إجراء بحث متقدم في الأدبيات المتعلقة بالهيئة العامة للرقابة المالية والتوجيه الدولي في تقييم المخاطر وإسناد المصدر بناءً على تسلسل الجينوم الكامل ومقاومة مضادات الميكروبات (AMR) ، لمعرفة وفهم المستوى العلمي الفعلي في هذا المجال بشكل أفضل وفهمه بشكل أفضل. ما هي أفضل الطرق لمقاربة الدراسة (على سبيل المثال لا الحصر ، بما في ذلك الأدبيات العلمية في هذا المجال أيضًا) (EFSA BIOHAZ Panel ، 2013).

    كان الغرض من WP1 هو الحصول على كامبيلوباكتر قاعدة بيانات تحتوي على نتائج التصنيف الجزيئي والبيانات الوصفية ذات الصلة من الناحية الوبائية ، جاهزة للتحليل. تم صنع الجزء الأكبر من WP هذا في الخطوة الأولى في المختبر المرجعي الوطني الإيطالي (NRL) من أجل كامبيلوباكتر. بروتوكول كامبيلوباكتر النيابة. يتم إجراء المراقبة بشكل روتيني بواسطة NRL الإيطالية ويتم ذلك عن طريق الزراعة وتحديد الهوية وفقًا لطريقة EN ISO 10272 الجزء 1 و 2 (ISO ، 2006: الأجزاء 1 و 2). يتم إجراء توصيف التنميط الجيني للعزلات من خلال تصنيف الأنواع عن طريق التأكيد الجزيئي عن طريق تفاعل البوليميراز المتعدد (PCR) (Wang et al. ، 2002) ، وتسلسل flaA-SVR (Nachamkin et al. ، 1993) ، ورحلان هلام المجال النبضي ( PFGE) (معهد العلوم والبحوث البيئية ، 2013) والإصدار 7.6 من برنامج BioNumerics (الرياضيات التطبيقية ، 2019) ، في كتابة تسلسل متعدد البؤرة سيليكو (MLST) (Dingle et al. ، 2008 Jolley et al. ، 2018 Seemann ، 2019) ، ومنذ عام 2017 ، ج. jejuni يتم تقديم العزلات تدريجياً إلى Core Genome MLST (cgMLST) لتحليل تمييزي أفضل (O'Mahony et al. ، 2011 Llarena et al. ، 2017). يتم تنفيذ جزء من أنشطة التسلسل هذه في إطار مشاريع وطنية ودولية مختلفة. يتم إجراء توصيف النمط الظاهري لـ AMR عن طريق اختبار القابلية لسبعة مضادات للميكروبات باستخدام طريقة تخفيف المرق الدقيق باستخدام النظام الآلي "Sensititre" (TREK Diagnostic Systems ، Biomedical Service ، إيطاليا) (Kittl et al.، 2013 EFSA، 2019).

    حتى الآن حوالي 3000 عزلة من كامبيلوباكتر spp. ، على التوالي ، التي تم جمعها في إيطاليا بأكملها ، متوفرة في مجموعة سلالات IZSAM. في هذه الخطوة ، شارك الزميل بنشاط في بعض الأساليب التحليلية المحددة المرتبطة بالزراعة والتوصيف الوراثي والنمط الظاهري لـ كامبيلوباكتر، لديه الفرصة لتطوير وتحسين مهاراته المعملية والتعرف على نظام المعلومات البيطرية الوطني (https://www.vetinfo.sanita.it/) ، الذي تديره IZSAM. خلال ورقة العمل هذه ، تعلم الزميل وفهم سير عمل المختبر بالكامل (الشكل 1) حتى الحصول على البيانات الأولية وتسجيلها في نظام المعلومات الإيطالي. في الوقت نفسه ، أصبح الزميل على دراية بالعالميين كامبيلوباكتر قاعدة بيانات MLST (https://pubmlst.org/) (Jolley et al. ، 2018) ، واستخدمتها لمقارنة البيانات وتطبيعها. تقوم IZSAM بجمع وتسجيل مجموعة محددة جيدًا من البيانات الموحدة لكل عينة تم اختبارها في مختبراتها. بالإضافة إلى ذلك ، يتم جمع العديد من العينات في إطار خطط المكافحة الوطنية ويتم تسجيل جميع البيانات ذات الصلة في نظام المعلومات البيطرية الوطني. كل هذه العوامل تسمح لـ IZSAM باسترداد البيانات الوبائية ذات الصلة لجميع العينات المختبرة. تعد هذه البيانات الوصفية الوبائية أساسية للتفسير الصحيح للنتائج الميكروبيولوجية ، بما في ذلك نتائج التصنيف الجزيئي والتنميط الظاهري (على سبيل المثال: مقاومة مضادات الميكروبات). تم تنفيذ خطوة ثانية في COVEPI ، حيث تم تطوير خطة مفصلة لتحليل البيانات ، بما في ذلك وصف مجموعة البيانات المراد استردادها ، ونوع فحوصات جودة البيانات التي يتعين إجراؤها ، وتنسيق قواعد البيانات التي تم التحقق من صحتها الناتجة. بعد استخراج البيانات الأولية ، قام الزميل باسترداد البيانات والتحقق منها وتطبيعها وتنظيمها من أجل التحليلات الوبائية اللاحقة. تم استخدام هذه البيانات في عزو المصدر للأمراض البشرية من خلال التصنيف الفرعي الميكروبي. (الهيئة الأوروبية للرقابة المالية ، 2008 ، 2019).

    2.2.2 WP2. تحليلات الكتلة والجمعيات

    ركز WP2 على الحصول على النتائج من تحليلات بيانات الكتابة الجزيئية وتحديد "مجموعات epi" الرئيسية C. jejuni من خلال تحليل بيانات الأنماط الجينية والطرز المظهرية وكذلك البيانات الوصفية الوبائية. في الخطوة الأولى ، أتيحت للزميل فرصة العمل في المركز المرجعي الوطني الإيطالي لتسلسل الجينوم الكامل لمسببات الأمراض الميكروبية (GENPAT). دعم خبراء المعلومات الحيوية في GENPAT معالجة وتحليل بيانات التسلسل وقدموا الزميل في المعلوماتية الحيوية وأطلعوه على برنامج المعلوماتية الحيوية (الشكل 3). لإجراء تحليل مقارن استنادًا إلى بيانات cgMLST ، تعلم الزميل واستخدم الحد الأدنى من الشجرة الممتدة باستخدام برنامج GrapeTree (الشكل 2) (Zhou et al. ، 2018). كانت الخطوة الثانية في وحدة الإحصاء ونظم المعلومات الجغرافية التابعة لـ COVEPI حيث تم تدريب الزميل على استخدام برنامج نظام المعلومات الجغرافية QGIS.خلال الخطوة الثالثة ، في COVEPI ، حلل الزميل البيانات لغرض التحقق من المجموعات الجينية ذات الدلالة الإحصائية لـ كامبيلوباكتر النيابة. (C. jejuni) المرتبطة بـ: الأنواع المحددة ، وأنواع المزارع ، ومنتجات إنتاج الأغذية ، والخصائص المظهرية المحددة ، مثل أنماط مقاومة مضادات الميكروبات أو أنماط زمانية مكانية محددة ، والثبات في مجموعات محددة من المزارع. كان العمل مع كمية كبيرة من البيانات أمرًا صعبًا ، مما دفع إلى التفكير في استخدام بعض برامج ذكاء الأعمال مثل MicroStrategy.

    2.2.3 WP3. تطوير نماذج تقييم المخاطر

    خلال WP3 ، في وحدة COVEPI ، تم استخدام طرق مختلفة لإسناد المصدر للعثور على الرئيسي وتوصيفه C. jejuni الأنماط الجينية وتقدير مساهمتها في التعرض الكامل للمستهلكين الإيطاليين. تم النظر في تطوير والتحقق من صحة نموذج تقييم المخاطر مع الأخذ في الاعتبار الأنماط الجينية والأنماط الظاهرية. في هذه الخطوة ، قام الزميل بتحليل الخصائص الجينية للميكروبات والسمات المظهرية للعزلات ، للعثور على بصمة الإصبع المشتركة وتحديد "مجموعة epi". داخل الفريق ، تم اختبار منهجيات مختلفة للإحصاء الحيوي.

    تمت محاولة نهج آخر من أجل تحديد منهجية معينة مخصصة لتقييم مصادر عدم اليقين في نماذج إسناد المصدر المستخدمة في كامبيلوباكتر تقييم المخاطر الميكروبية (MRA). كانت المنهجيات المدروسة هي: تحليل تأثير وضع الفشل (FMEA) ، تحليل شجرة الخطأ (FTA) ومؤشرات العملية الرئيسية (KPI) / مؤشرات الجودة (QIs). قبل البدء في التقييم ، يجب تحديد الجهات الفاعلة والمراحل (ما قبل التحليل ، التحليلي ، التحليلي ، التحليلي وما بعد التحليل).

    2.2.4 الأنشطة الثانوية

    تتم الإشارة إلى الأنشطة الثانوية حول الاتفاقيات والتعاون بين مواقع الاستضافة والمنظمات الأصلية ، والتعاون بين المنظمات المختلفة وأيضًا إلى الأنشطة الأخرى غير المذكورة من قبل ، والتي لعب فيها الزميل دورًا نشطًا.

    2.2.4.1 الاتفاقات والتعاون

    في ضوء الأوبئة الأخيرة في أوروبا ، والاستفادة من برنامج الزمالة هذا خلال هذه الفترة ، تم وضع الأسس لإنشاء وتعزيز التعاون بين المراكز المرجعية الوطنية في إيطاليا ورومانيا ، من IZSAM و Teramo ومعهد التشخيص والصحة الحيوانية (IDAH) ، بوخارست. كانت الخطوة الأولى هي إجراء ورشة عمل لمدة يومين لتقييم مخاطر صحة الحيوان والأمراض المنقولة بالنواقل خلال الفترة من 2 إلى 3 أبريل 2019 للمتخصصين من IDAH في بوخارست ، بتنسيق علمي من الزميل ومشاركة مدرسين من IZSAM ، باولو Calistri و Federica Monaco ومن مجلس البحوث الزراعية - Onderstepoort Veterinary Research (ARC-OVR) ، غيرت فنتر. كانت الخطوة الثانية هي تقييم احتياجات التدريب المهني في علم الأوبئة للأخصائيين الرومانيين ، بغرض إيجاد الحل الأمثل لتحسين وزيادة القدرة على تقييم مخاطر الصحة الحيوانية. اعتمادًا على حجم الاحتياجات التدريبية ، تم النظر في التدريب المؤقت لعدد محدود من المتخصصين في IZSAM ، أو بدء مشروع توأمة ، إذا كانت الاحتياجات أكثر تعقيدًا. هذه العملية جارية.

    في نفس السياق ، قدمت الرابطة الأوروبية للسلامة الحيوية (EBSA) ، خلال مؤتمرها السنوي الثاني والعشرين في بوخارست ، من إجمالي 42 ، مشاركة برعاية 24 متخصصًا من رومانيا بما في ذلك IDAH و ANSVSA ، للمشاركة في دورات ما قبل المؤتمر (8) في مجال السلامة البيولوجية والأمن البيولوجي ، وكذلك للمشاركة في المؤتمر (6). بالنظر إلى أهمية الموضوعات في هذه المنطقة ، زادت المناطق البحرية المهمة إيكولوجيا أو بيولوجيا بأكثر من أربعة أضعاف عدد المشاركات المدعومة للأشخاص من منطقة البلقان (رومانيا وبلغاريا وجمهورية مولدوفا وألبانيا وكرواتيا وأوكرانيا وجورجيا واليونان) لهذا العام . بعد هذه التجربة الناجحة ، بدأ النظر في أنواع مختلفة من التعاون بين المنظمات وأعضائها.

    في الربع الأخير من برنامج EU-FORA ، ساهم الزميل في توصيف بعض مسببات الأمراض (مثل العطيفة الصائمية) في الاستجابة المحتملة لتغير المناخ ، من حيث الزيادة المحتملة في التعرض أو الإمراضية في إطار سيناريو محدد لتغير المناخ ، وهو جزء من مشروع CLEFSA ، بتنسيق من Angelo Maggiore (EFSA).

    2.2.4.2 أنشطة إضافية

    خلال الفترة من 13 إلى 15 نوفمبر 2018 ، شارك الزميل في اجتماع هيئة الصحة البيطرية الوطنية الرومانية وسلامة الأغذية (ANSVSA) في بايا ماري ، رومانيا ، لتقديم برنامج زمالة الاتحاد الأوروبي FORA ومقدمة في إدارة المخاطر ، والمفاهيم الأساسية في تقييم المخاطر للمتخصصين من شبكة المختبرات الوطنية.

    شارك الزميل في ورشة عمل بعنوان "محاسبة عدم اليقين في سيناريوهات ضعف البيانات: دراسات حالة حول تحليل المخاطر في سلامة الأغذية" وفي المؤتمر الدولي حول عدم اليقين في تحليل المخاطر ، 20-22 فبراير 2019 ، برلين في المعهد الفيدرالي الألماني للمخاطر التقييم (BfR) ، مع "تقييم عدم اليقين في كامبيلوباكتر النيابة. نماذج إحالة المصدر: عرض ملصق لبعض الأساليب النوعية في المجال المواضيعي "طرق تحليل عدم اليقين".

    شارك الزميل في المؤتمر الدولي السنوي الثاني والعشرون `` مواضيع محترقة في السلامة الحيوية '' لمنطقة المناطق البحرية المهمة إيكولوجيا أو بيولوجيا في بوخارست ، رومانيا ، في الفترة من 2 إلى 5 أبريل 2019 ، حيث قام بالإشراف مع الخبيرين باولو كاليستري (IZSAM) وأوي مولر دوبليس (MSD) اندلاع "السلامة البيولوجية والأمن البيولوجي في الميدان في حالة الطوارئ". كما قدم الزميل ملصقين: "التعرض ل كامبيلوباكتر النيابة. من العاملين في صناعة الأغذية: نظرة عامة موجزة "و" EFSA EU-FORA - برنامج الزمالة الأوروبي لتقييم مخاطر الغذاء ".

    مثل الضيف والمتعاون المدعوين ، شارك الزميل في "مدرسة Transylvanian Experimental Neuroscience Summer School - TENSS 2019" خلال الفترة من 15 إلى 16 يونيو 2019 ، بايك ليك ، رومانيا ، التي نظمها معهد ترانسيلفانيان لعلم الأعصاب (TINS).


    1 المقدمة

    كانت المعرفة بفيروس زيكا نادرة في العديد من البلدان عالية الموارد حتى بدأ الوباء في البرازيل في عام 2015. 1 تم الإعلان عن حالة طوارئ صحية عامة ذات أهمية دولية في الأمريكتين بعد أن أكدت 48 دولة حالات إصابة أصيلة بزيكا عن طريق انتقال ناقلات الأمراض. أبلغت لجنة الطوارئ التابعة لمنظمة الصحة العالمية عن حالات صغر الرأس واضطرابات عصبية أخرى في المناطق الموبوءة بالمرض. 2

    في كولومبيا ، أفادت المعلومات التي قدمها النظام الوطني لمراقبة الصحة العامة (SIVIGILA) من خلال النشرة الوبائية للمعهد الوطني الكولومبي للصحة (NIH) أنه منذ أن تم تحديد المرض لأول مرة في الأسبوع الوبائي 29 من عام 2015 حتى المرحلة المتوطنة ، تم تحديد ما يقرب من 105000 حالة مصحوبة بأعراض عدوى فيروس زيكا ، بما في ذلك أكثر من 19000 حالة بين النساء الحوامل. بلغ معدل الحدوث خلال المرحلة الوبائية 377.7 حالة لكل 100000 نسمة. 3

    تم إجراء العديد من الدراسات للتحقيق في أسباب وسلوك مرض فيروس زيكا في كولومبيا. باتشيكو وآخرون قدر 4 خطر المرض في البلاد ووجد أن معظم المقاطعات لديها معدل حدوث متراكم يتراوح بين 0.1 و 129.7 لكل 100000 من السكان. Rojas et al. قام 5 بتحليل البيانات لتقييم حدوث الفيروس في جيراردوت وجزيرة سان أندريس ، ومعدلات الهجوم المقدرة 18.43 و 12.13 لكل 1000 نسمة ، على التوالي.

    على الرغم من أن نتائج الدراسات السابقة توفر معلومات مهمة حول استخدام البيانات الخام ، إلا أنها تظهر تباينًا كبيرًا وتأخذ في الاعتبار العلاقات المكانية بين الملاحظات فقط وفقًا للحدود الجغرافية لكل مقاطعة. لا تأخذ هذه الدراسات في الاعتبار تأثير العوامل الأخرى ، مثل حجم المستوطنة ، وحجم المستوطنات المجاورة ، والعلاقة بين منطقة الخطر والمناطق المجاورة ، والتي يمكن أن تؤثر جميعها على المخاطر المكانية والزمانية للإصابة بفيروس زيكا.

    تتكون البيانات الصحية بشكل عام من تعدادات مجمعة للأمراض داخل الوحدات الإدارية (مناطق صغيرة) مثل الإدارات والبلديات. لتقدير مخاطر المرض ، يتم استخدام تقديرات الاحتمالية القصوى ، مثل معدل المراضة المعياري (SMR). هذه المعدلات متغيرة لأنها تعتمد على القيم المتوقعة ، والتي بدورها تعتمد على حجم السكان.

    عند رسم خريطة التوزيع الجغرافي لمرض ما ، فإن الهدف هو اكتشاف الأنماط المكانية التي تساعد في تفسير السلوك وتمكين الفرضيات حول مسبباته. استخدمت الدراسة الحالية طرق التجانس البايزية لتقدير مخاطر المراجعة المكانية للهياكل الجغرافية لسلوك المرض. تم تطوير مجموعة واسعة من النماذج في رسم خرائط المرض لتقديم تقديرات المخاطر النسبية المناسبة. مع الأخذ في الاعتبار معلومات المنطقة ، توفر هذه النماذج خرائط مخاطر متجانسة وتحسن التقديرات.

    واحدة من أهم الدراسات في تقدير المخاطر هي دراسة بيساج وآخرون. 6 يتم تقدير المخاطر باستخدام نموذج يلتقط هيكل المخاطر من خلال دمج المعلومات من المناطق المجاورة. الهدف هو تحديد أي علاقة مكانية تكشف سلوك المرض ، وكيفية توزيعه ، وما إذا كانت هناك عوامل مختلفة تفسر هذا السلوك. بيساج وآخرون. اقترح رقم 6 نموذجًا هرميًا بايزيًا يصور المخاطر ، بدمج عاملين عشوائيين: أحدهما يشرح الاعتماد المكاني بين المناطق المجاورة والآخر يشرح الآثار المتبقية. بعض الإضافات والمساهمات في نموذج Besag هي أعمال Bernardinelli et al. و 7 Best et al. و 8 و Lawson. 9 ، 10

    كان الهدف من هذه الدراسة هو تحديد التوزيع المكاني لخطر الإصابة بمرض فيروس زيكا في كل منطقة من مناطق كولومبيا خلال وباء 2015-2016 باستخدام نموذج بايزي الهرمي.


    الملخص

    غالبًا ما يكون للعواصف الرعدية فائقة الخلية توقيعات واضحة لفرز حجم النيزك المائي داخل مناطقها الأمامية ، بما في ذلك منطقة على شكل قوس ذات انعكاسية تفاضلية عالية (ضالدكتور) على طول حافة التدفق للجناح الأمامي المعروفة باسم ضالدكتور القوس والفاصل الأفقي الواضح بين هذه المنطقة المرتفعة ضالدكتور القيم ومجال تعزيز كموانئ دبي القيم أعمق في قلب العاصفة. وقد أشار العمل الأخير إلى ذلك ضالدكتور القوس و كموانئ دبيضالدكتور قد تكون توقيعات الفصل في العواصف فائقة الخلايا مرتبطة بالطائرة النسبية للعاصفة البيئية والقص منخفض المستوى. وبالتالي ، قد تكون خصائص هذه التواقيع مفيدة للإشارة إلى ما إذا كان من المحتمل أن تنتج عاصفة ما إعصارًا أم لا. برغم من ضالدكتور القوس و كموانئ دبيضالدكتور عادةً ما يكون من السهل تحديد توقيعات الفصل نوعياً في مجالات الرادار ذات الاستقطاب المزدوج ، وقد يستغرق تحديد خصائصها وقتًا طويلاً ويجعل البحث في هذه التواقيع وتطبيقاتها التشغيلية المحتملة أمرًا صعبًا. لمعالجة هذه المشكلة ، تقدم هذه الورقة خوارزمية Python آلية لتحديد وتتبع هذه التوقيعات بشكل موضوعي في بيانات رادار مراقبة الطقس 1988 (WSR-88D) وتحديد خصائصها. ستناقش هذه الورقة تطوير الخوارزمية ، وإظهار أدائها من خلال مقارنات مع سلاسل زمنية يتم إنشاؤها يدويًا من ضالدكتور القوس و كموانئ دبيضالدكتور خصائص توقيع الفصل ، واستكشف بإيجاز الاستخدامات المحتملة لهذه الخوارزمية في البحث والعمليات.


    نتائج

    تم جمع وتحليل العينات من 681 إنسانًا في 269 أسرة ومن 853 من الماشية في 249 أسرة. تم الحصول على عينات بشرية وحيوانية من 229 أسرة. لم يتم اختبار أي من العينات البشرية إيجابية كامبيلوباكتر عن طريق الثقافة ، ولكن بواسطة PCR 82 عينة (12 ٪) كانت كامبيلوباكتر إيجابي C. jejuni تم اكتشافه في 66 عينة (80٪) و بكتيريا القولونية في 16 عينة (20٪). تم الكشف عن العينات الإيجابية بشكل ملحوظ في كثير من الأحيان عند الأطفال دون سن 16 عامًا ، حيث تم اختبار 19 ٪ من العينات إيجابية بالنسبة لهم C. jejuni أو بكتيريا القولونيةمقارنة مع 8٪ من العينات من الذكور البالغين (p = 0.002) و 7٪ من العينات من الإناث البالغات (p & lt 0.001) (الجدول 1 والشكل 2 أ). لا توجد فروق ذات دلالة إحصائية في نسبة كامبيلوباكترتم العثور على عينات إيجابية تم الكشف عنها بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل بين الذكور والإناث البالغين أو بين المناطق للأطفال والبالغات. بالنسبة للذكور البالغين ، كانت نسبة العينات الإيجابية أعلى بشكل ملحوظ في مقاطعة باتامبانج (10٪) منها في مقاطعتي كامبونج شام (8٪) وكامبوت (5٪) (الجدول 2).

    طريقة عدد (٪) العينات الموجبة
    الأطفال 0-15 سنة (ن = 272) ذكور و GT 15 سنة (ن = 167) إناث و GT15 سنة (ن = 242)
    الثقافة: إيجابية كامبيلوباكتر 0 0 0
    PCR: إيجابي لـ C. jejuni أو C. coli 51 (19) 13 (8) 18 (7)
    C. jejuni 42 (15) 9 (5) 15 (6)
    بكتيريا القولونية 9 (3) 4 (2) 3 (1)
    نوع العينة PCR: عينات إيجابية لـ C. jejuni أو C. coli أو كليهما الثقافة: عينات إيجابية ل كامبيلوباكتر
    KPC ، ن (%) BTB ، ن (%) KPT ، ن (%) ف القيمة أ اختبار مربع تشي.
    KPC ، ن (%) BTB ، ن (%) KPT ، ن (%) ف القيمة أ اختبار مربع تشي.
    الأطفال 0-15 سنة (ن = 272) 13 (17) 16 (15) 22 (25) 0.18 0 0 0
    ذكور ˃ 15 سنة (ن = 167) 2 (8) 8 (10) 3 (5) 0.05 0 0 0
    الإناث: 15 سنة (ن = 242) 5 (6) 8 (10) 5 (7) 0.58 0 0 0
    دجاج (ن = 353) 57 (52) 86 (60) 55 (56) 0.45 31 (28) 27 (19) 29 (29) 0.1
    البط (ن = 101) 3 (11) 16 (30) 5 (24) 0.17 2 (7) 2 (4) 1 (5) 0.13
    الخنازير (ن = 162) 23 (58) 43 (72) 51 (82) 0.02 2 (5) 5 (8) 4 (6) 0.07
    ماشية (ن = 207) 5 (6) 4 (6) 2 (35) 0.74 1 (1) 1 (1) 0
    • عينات من مقاطعة كامبونج شام (KPC) ، مقاطعة باتامبانج (BTB) ومقاطعة كامبوت (KPT) ، كمبوديا ، 2011-2013.
    • أ اختبار مربع تشي.

    تم اختبار عينات البراز من الدجاج والبط والخنازير والماشية وجاموس الماء والسمان والحمام والأوز عن طريق الاستزراع و PCR (الجدول 3 والشكل 2 ب). من بين 853 عينة من الماشية ، كامبيلوباكتر عن طريق الزرع في 106 عينات (12٪) 72 عينة (68٪) تم اختبارها إيجابية C. jejuni و 31 عينة (29٪) ل بكتيريا القولونية، بينما في ثلاث عينات (3٪) كامبيلوباكتر لا يمكن تحديد الأنواع. في تحليل PCR ، كامبيلوباكتر تم الكشف عنها في 352 عينة (41٪). من بين جميع العينات الإيجابية في تحليلات PCR ، C. jejuni تم اكتشافه فقط في 177 (50٪) ، بكتيريا القولونية فقط في 124 (35٪) وكلاهما C. jejuni و بكتيريا القولونية في 51 عينة (14٪). مقارنة بين كامبيلوباكتر يتم عرض الأنواع المكتشفة في عينات الماشية حسب الثقافة و PCR في الجدول 4. لا توجد أي من العينات التي تم جمعها من الجاموس (ن = 25) وسمان (ن = 1) تم اختباره إيجابيًا لـ كامبيلوباكتر عن طريق الاستزراع أو تفاعل البوليميراز المتسلسل ، ولكن إحدى عينات الحمام (ن = 3) تم اختباره إيجابيًا لـ C. jejuni عن طريق الثقافة و PCR وعينة الإوزة الوحيدة (ن = 1) تم اختباره إيجابيًا لـ C. jejuni بواسطة PCR ، ولكن ليس بالثقافة. كانت هناك فروق معنوية (p & lt 0.001) في نسبة كامبيلوباكتر-عينات إيجابية في تحليل تفاعل البوليميراز المتسلسل بين أربعة أنواع من الدجاج والبط والخنازير والماشية. ومع ذلك ، لوحظ اختلاف إقليمي في نسبة العينات الإيجابية في تحليلات تفاعل البوليميراز المتسلسل فقط للخنازير (p = 0.02) بين أنواع الماشية الرئيسية الأربعة (الجدول 2).

    طريقة عدد (٪) العينات الموجبة
    دجاج (ن = 353) البط (ن = 101) الخنازير (ن = 162) ماشية (ن = 207)
    الثقافة: إيجابية كامبيلوباكتر 87 (25) 5 (5) 11 (7) 2 (1)
    C. jejuni 66 (19) 4 (4) 0 1 (0.5)
    بكتيريا القولونية 19 (5) 1 (1) 10 (6) 1 (0.5)
    ج. spp.a أ مؤكد كامبيلوباكتر spp. ، لا يمكن تحديد الأنواع.
    2 (1) 0 1 (1) 0
    PCR: إيجابي لـ C. jejuni أو C. coli أو كليهما ب ب تم اختبار 51 عينة إيجابية لكليهما C. jejuni و بكتيريا القولونية.
    198 (56) 24 (24) 117 (72) 11 (5)
    C. jejuni 185 (52) 18 (19) 19 (12) 4 (2)
    بكتيريا القولونية 50 (14) 8 (8) 110 (68) 7 (35)
    • أ مؤكد كامبيلوباكتر spp. ، لا يمكن تحديد الأنواع.
    • ب تم اختبار 51 عينة إيجابية لكليهما C. jejuni و بكتيريا القولونية.
    الكشف الجزيئي عن طريق PCR الكشف عن طريق الثقافة الروتينية
    C. jejuni بكتيريا القولونية غير محدد أ مؤكد كامبيلوباكتر spp. ، لا يمكن تحديد الأنواع.
    C. jejuni 50 5 0
    بكتيريا القولونية 3 14 2
    عدوى مختلطة (C. jejuni و بكتيريا القولونية) 8 9 0
    لم يتم الكشف عن بكتيريا القولونية أو C. jeuni 11 3 1

    مناقشة

    تشير نتائج هذه الدراسة بوضوح إلى أن العديد من الأنواع الموصوفة من موروليكوس اجتمعوا معًا لتشكيل تصنيفات عالمية عميقة ، بدلاً من كيانات متباينة منفصلة ، كما تم الإبلاغ سابقًا. تحليلاتنا للتطور الوراثي لـ موروليكوس على نطاق عالمي يشير إلى أربع مجموعات رئيسية مع تقسيم جغرافي واضح (الشكلان 2 و 3). يوجد داخل Clade 4 تباعد ضحل نسبيًا بين كليد وسط / شرق شمال الأطلسي (4A) وكليد "جنوبي" عالمي (4B: جنوب المحيط الهادئ وجنوب المحيط الأطلسي والمحيط الهندي + شمال غرب المحيط الهادئ). على الرغم من أن تحليلات ترسيم حدود الأنواع تشير إلى أن هذه المجموعة قد تكون نوعًا واحدًا ، إلا أن هناك درجة من الفصل بين شمال المحيط الأطلسي / البحر الأبيض المتوسط ​​ومجموعة نصف الكرة الجنوبي التي يغلب عليها الطابع الجنوبي ونقترح الحفاظ على مويليري لشمال الأطلسي / البحر الأبيض المتوسط ​​(نوعان سابقًا) و M. australis لنصف الكرة الجنوبي (خمسة أنواع سابقًا). تتوافق هذه الواجهات مع الواجهات "الشمالية" و "الجنوبية" التي حددها Rees et al. 13 ولكن مع توسع جغرافي كبير لفرع نصف الكرة الجنوبي وامتداد للمجموعة الشمالية لتشمل موروليكوس من غرب جرينلاند. تشير بياناتنا إلى أن النطاق الجغرافي للفرع "الجنوبي" يشمل موروليكوس من شيلي وجزر غالاباغوس. ضمن هذه المجموعة ، تمت مشاركة النمط الفرداني للأغلبية من خلال عينات من النطاق بأكمله (باستثناء جزر غالاباغوس ، التي لم يتوفر منها سوى عدد قليل من العينات) ولوحظ انخفاض التباين الوراثي للكتلة ككل (الحد الأقصى لتأثير COI) المسافة الاحتمالية 1.2٪).

    بالنسبة للكليد "الجنوبي" (Clade 4B) ، هناك نقص في التمايز الجيني والمورفولوجي بين شمال المحيط الهادئ م. japonicus، جنوب المحيط الهادئ / المحيط الهندي M. australis وجنوب المحيط الأطلسي M. والفيسينسيس تمت الإشارة إليه سابقًا ، مع دراسات تقترح ترادفًا لـ M. والفيسينسيس و م. japonicus 16،17 والتوسع اللاحق ليشمل كلاهما كمرادفات مبتدئة لـ M. australis 13 ، 18. على أساس وراثي ، تم توسيع هذه المجموعة الآن لتشمل نوعين من شرق المحيط الهادئ ، م. بريفيكولوس و M. بارفيبينيس. علاوة على ذلك ، تم وصف العديد من الأنواع الأخرى بتوزيعات محدودة للغاية تقع ضمن النطاق الجغرافي للكليد "الجنوبي". في شمال المحيط الهادئ ، إمبيراتوريوس يرتبط بجبل الإمبراطور البحري الذي يبلغ تعداد سكانه م. japonicus وجدت في الغرب حول اليابان والشرق حول هاواي. في ضوء بياناتنا ، يبدو من غير المحتمل أن يكون ذلك مختلفًا موروليكوس الأنواع لا تزال قائمة في هذه الجبال البحرية ، وبدلاً من ذلك ربما يكون أكثر احتمالاً أن تمثل هذه الأنواع أعدادًا إضافية من الكليد "الجنوبي" واسع الانتشار موروليكوس.

    قد تنطبق حالة مماثلة على اختراع م في جنوب المحيط الأطلسي و M. rudjakovi في شرق جنوب المحيط الهادئ. تم وصف كلا النوعين بتوزيعات مقتصرة على الجبال البحرية (اكتشاف الجبال البحرية والجبال البحرية في سلسلة نازكا ريدج ، على التوالي) المجاورة أو المتداخلة ضمن نطاقات موصوفة من الأصناف الأخرى التي تم تحديدها الآن كجزء من كليد واسع الانتشار في نصف الكرة الجنوبي. سكان موروليكوس على الجبال البحرية في جنوب المحيط الأطلسي ، تم الإبلاغ عن أنها تتألف بشكل رئيسي من عينات غير ناضجة 40 ، وقد اقترح أن هذه تعتمد على التأجيل من التجمعات السكانية بالقرب من الأرجنتين وجزيرة تريستان دا كونها 41. ما إذا كان هؤلاء السكان مكتفين ذاتيا أو يحتاجون إلى تجنيد من السكان المجاورين غير معروف. وبأخذ هذا أبعد من ذلك ، فمن بين الأنواع الخمسة الموصوفة التي لم نتمكن من تضمينها في عملنا حتى الآن (الدوائر البيضاء في الشكلين 1 و 6) ، أربعة منها لها توزيعات محلية للغاية (الجبال البحرية أو ، في حالة M. kornilovorum، بنك سايا دي مالها في المحيط الهندي).

    المصدر QGIS 19. تمت إضافة الرموز باستخدام Adobe Illustrator.

    خريطة منقحة لـ موروليكوس توزيع الأنواع. تمثيل التجمعات الجينية الحالية ل موروليكوس، لون مشفر ليعكس مجموعات النمط الفرداني COI والأنواع المفترضة المقترحة: (1) مويليري (2) M. australis (3) م. موكروناتوس (4) م. ويتسماني و (5) غير معهود حاليا موروليكوس الأنواع من وسط جنوب المحيط الهادئ. يشار إلى الأنواع غير المستندة إلى عينات كما في الشكل 1. تم إنشاء الخريطة الأساسية من مجموعة بيانات GSHHG World Vector Shoreline (WVS الإصدار 2.3.7) باستخدام Open

    انعكس التباعد الضحل بين الواجهات "الجنوبية" وشمال المحيط الأطلسي / البحر الأبيض المتوسط ​​من خلال تحليل bPTP (Bayesian) ، مع دعم منخفض لهذين النوعين المفترضين. نتج عن تحليل GMYC أيضًا أنواع مفترضة للكتل "الشمالية" و "الجنوبية" ولكن أيضًا قسم ثلاثة أنماط فردانية يابانية من الكليد الجنوبي إلى مجموعة أنواع منفصلة ، والتي يبدو أنها تؤكد على ميل هذه الطريقة نحو التقسيم الزائد (على سبيل المثال 32،35 .) وتحد من الثقة في هذه النتيجة. "الشمالية" و "الجنوبية" موروليكوس clades ، تم العثور عليها مسبقًا بواسطة Rees et al. 13 لتشكيل مجموعات غير متصلة في شبكات النمط الفرداني TCS استنادًا إلى بيانات COI ، تشكل الآن شبكة فرعية مفردة بسبب "الجسور" للأنماط الفردانية الناتجة عن تضمين مادة من اليابان (الشكل 4). ومع ذلك ، على الرغم من أخذ العينات على نطاق واسع ، لم يتم العثور على أنماط فردانية مشتركة بين موروليكوس من هاتين المنطقتين والأنماط الفردانية الأكثر تشابهًا من المنطقتين تظل مفصولة بـ 10 بدائل (الشكل 4). نظرًا لعدم العثور على أنماط الفردانية المشتركة بين مناطق شمال الأطلسي و "الجنوبية" ، فقد تكون نتائجنا تعكس صعوبة طرق تحديد الأنواع في التعامل مع الأنواع ذات الاختلاف الضحل.

    موروليكوس ويتسماني من خط الاستواء وشمال غرب المحيط الأطلسي ، إلى جانب م من غرب جنوب المحيط الأطلسي ، تشكل أيضًا نوعًا مفترضًا واحدًا (Clade 3) ، والذي نقترح أنه مرادف م. ويتسماني. تم استرداد نوع واحد في جميع تحليلات تعيين حدود الأنواع تقريبًا (الشكل 5). كان الاستثناء في تحليل GMYC ، حيث تم تمييز عينات خط الاستواء الشرقي عن غرب المحيط الأطلسي موروليكوس. تم الإبلاغ في البداية عن مسافة جغرافية كبيرة بين توزيعات م (المنحدر القاري في غرب جنوب المحيط الأطلسي ، بين 34 درجة و 40 درجة جنوبا) و م. ويتسماني (غرب شمال الأطلسي إلى خليج المكسيك والمحيط الأطلسي الاستوائي من 45 درجة غربًا إلى منحدرات إفريقيا 12). ومع ذلك ، الدراسات اللاحقة م وسع نطاق هذه الأنواع المفترضة إلى 11 درجة جنوبا في غرب المحيط الأطلسي 14 ، مما أدى إلى تضييق الفجوة بشكل ملحوظ بين التوزيعات المعروفة للنوعين الموصوفين في غرب المحيط الأطلسي. تسلسل COI لـ موروليكوس من خارج البرازيل غير واضح نسبيًا عن المجموعات السكانية الأخرى في هذا الكليد ، ويختلف فقط من خلال استبدال واحد إلى اثنين (مقارنة بحد أدنى سبعة بدائل [1.9 ٪] بين غرب وشرق المحيط الأطلسي الاستوائي الشكل 4).

    يمثل الكيانان المتبقيان (1 و 2) سلالة شديدة التباين تحتوي على نوعين مميزين ، أحدهما من البحر الأحمر (م. موكروناتوس) وواحد من وسط جنوب المحيط الهادئ (sp. غير محدد). موروليكوس موكروناتوس يمثل Klunzinger، 1871 (Clade 1) أحد الأنواع الموصوفة سابقًا في الجنس الذي يقتصر على البحر الأحمر ويتميز بوضوح في جميع تقديرات ترسيم حدود الأنواع بناءً على بيانات COI (الشكل 5). متميز بنفس القدر هو موروليكوس الأنواع من وسط جنوب المحيط الهادئ (Clade 2) ، والتي تختلف بشدة عن جميع Clades الرئيسية الأخرى ويتم تحديدها بوضوح على أنها من الأنواع المفترضة في جميع التحليلات. يبدو أن مادتنا تمثل السجلات الأولى في المنطقة لهذا الجنس. التوزيعات المعروفة المستندة إلى مجموعات المتاحف والبيانات المنشورة والعينات التي فحصها Parin و Kobyliansky 12 (انظر نظرة عامة في الشكل 1) تشير إلى عدم وجود معلومات معروفة موروليكوس الأنواع الموجودة في هذه المنطقة. بدون مواد لإجراء التحليلات المورفولوجية الكافية ، لا يمكننا تحديد خصائص وسط جنوب المحيط الهادئ رسميًا موروليكوس في الوقت الحاضر ، لدينا عينة كاملة واحدة فقط متاحة. ومع ذلك ، تشير البيانات الجزيئية والتوزيعية إلى أن هذا قد يمثل نوعًا غير موصوف.

    النطاق الجغرافي لوسط جنوب المحيط الهادئ موروليكوس غير معروف ولكن العينات التي قمنا بها تشمل فيجي وبولينيزيا الفرنسية وساموا الأمريكية. منذ موروليكوس من فيجي وبولينيزيا الفرنسية تم الحصول عليها من التونة الكبيرة التي تم اصطيادها بخيوط طويلة ، يجدر التعليق على يقين المواقع المحتملة حيث توجد هذه موروليكوس تم تناولها بالنسبة لمكان صيد التونة. فريسة صغيرة مثل موروليكوس من المحتمل أن يتم هضمها بالكامل بواسطة التونة في غضون 4-5 ساعات كانت عيناتنا سليمة نسبيًا ، وبناءً على متوسط ​​سرعات السباحة والسماح بالوضع غير المعروف للنقطة الدقيقة التي تم فيها اصطياد التونة على الحبل الطويل ، قُدر الابتلاع بـ 100– 150 كم من موقع الصيد (فاليري ألين ، اتصالات.). وصف عدد من موروليكوس تم العثور على الأنواع في المناطق المجاورة ، ولكن على مسافة كبيرة من هذه المنطقة إلى الشمال (م. japonicus و إمبيراتوريوس)، جنوب (M. australis)، غرب (M. javanicus) والشرق (م. بريفيكولوس, M. rudjakovi, M. بارفيبينيس انظر الشكل 1). تم تضمين أربعة من هذه الأنواع السبعة المفترضة كجزء من هذه الدراسة وتشكل جزءًا من الكليد "الجنوبي" الذي لا يمكن تمييزه وراثيًا بينما يوجد اثنان آخران لهما نطاقات محدودة للغاية تقع ضمن توزيعات الأنواع المأخوذة من العينات ، وبالتالي فإننا نعتبر أن هناك حالة مشكوك فيها إلى حد ما (الشكلان 1 و 6 انظر المناقشة أدناه). آخر الأنواع المتبقية M. javanicus، ورد أنها وزعت في شرق المحيط الهندي الاستوائي قبالة جاوة وأستراليا وشمال بحر المرجان 12. في الوقت الحاضر ، لا يمكننا أن نستبعد أن يكون وسطنا جنوب المحيط الهادئ موروليكوس قد يمثل توزيعًا موسعًا لأنواع موصوفة لم يتم أخذ عينات منها -M. javanicus كونه المرشح الأكثر احتمالا. لفحص هذا الاحتمال ، سنحتاج إلى عينات تم جمعها من النطاق الموصوف لـ M. javanicus التي يمكن مقارنتها بموادنا في وسط جنوب المحيط الهادئ.

    تشير بياناتنا إلى عدم وجود دعم لصيانة العديد من الأنواع التماثلية الموصوفة حاليًا في هذا الجنس. على العكس من ذلك ، فإن أعضاء موروليكوس يبدو أنه نوع حقيقي من نوع eucosmopolitan 42 —taxa مع توزيع طبيعي وعالمي ما قبل التاريخ (أو واسع للغاية). يقدم الشكل 6 ملخصًا للتجمعات الجغرافية بناءً على تحليلات تحديد الأنواع والتوصيات اللاحقة ، وتحديث معلومات التوزيع الواردة في الشكل 1. مطلوب مزيد من البيانات لتقييم مستويات تدفق الجينات بين ما يبدو مفصولًا موروليكوس السكان وما إذا كان هذا كافياً لمنع الاختلاف التطوري. قد تكون بعض المجموعات السكانية في طور الانتواع الخيفي في أحواض المحيطات المختلفة. قد يكون هذا هو الحال مع الكتل "الشمالية" و "الجنوبية" ، حيث لم يتم العثور على أنماط فردانية مشتركة بينهما ، وبالتالي فقد احتفظنا بالفصل بين الكليد 4A و 4 B في الشكل 6 حتى تتوفر المزيد من البيانات. هناك حاجة إلى بيانات إضافية ، لا سيما مسح واسع الانتشار جغرافيًا يتضمن علامات وراثية على مستوى السكان ، للتحقق من حدود الأنواع المفترضة المحددة هنا. مزيد من الدراسات حول موروليكوس وعد بتقديم رؤى قيمة في الطبيعة المعقدة للأنواع في المحيطات المفتوحة.


    شاهد الفيديو: QGIS Basic #100: AddImport SVG files from layer properties in QGIS (شهر اكتوبر 2021).